29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2685 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2685  hypothetical protein  100 
 
 		 528 aa  1072    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.2738  normal  0.0170599 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1050  protein of unknown function DUF945  28.1 
 
 		 458 aa  99.8  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1987  hypothetical protein  24.15 
 
 		 514 aa  87  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2339  protein of unknown function DUF945  23.73 
 
 		 516 aa  86.3  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1875  hypothetical protein  24.15 
 
 		 514 aa  86.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.441836  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2268  hypothetical protein  24.15 
 
 		 514 aa  86.3  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0586  hypothetical protein  22.95 
 
 		 485 aa  85.1  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2276  hypothetical protein  25.32 
 
 		 509 aa  80.5  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0556311 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0605  hypothetical protein  23.13 
 
 		 485 aa  78.2  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2038  hypothetical protein  24.48 
 
 		 516 aa  78.2  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2139  protein of unknown function DUF945  22.73 
 
 		 517 aa  67.4  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.434013  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1903  protein of unknown function DUF945  26.64 
 
 		 514 aa  59.3  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.319398  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1585  hypothetical protein  26.55 
 
 		 502 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2016  hypothetical protein  26.55 
 
 		 502 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235486  normal  0.970517 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01583  hypothetical protein  26.55 
 
 		 502 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1800  hypothetical protein  26.55 
 
 		 502 aa  55.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2324  hypothetical protein  26.55 
 
 		 502 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1822  hypothetical protein  26.55 
 
 		 502 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615092  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01573  hypothetical protein  26.55 
 
 		 502 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1689  hypothetical protein  26.55 
 
 		 502 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2029  protein of unknown function DUF945  26.55 
 
 		 502 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0265099  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03967  hypothetical protein  20.48 
 
 		 477 aa  53.9  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1575  hypothetical protein  27.64 
 
 		 502 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.193495  normal  0.310503 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1634  hypothetical protein  27.64 
 
 		 502 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00065712  normal  0.987558 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1565  protein YdgA  27.56 
 
 		 502 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.402568  normal  0.107029 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1708  protein YdgA  27.64 
 
 		 502 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.366845  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1877  hypothetical protein  27.56 
 
 		 502 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.710418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3576  hypothetical protein  22.57 
 
 		 430 aa  48.5  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.723089  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1829  hypothetical protein  26.42 
 
 		 514 aa  43.5  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00725153 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>