42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2276 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2276  hypothetical protein  100 
 
 		 509 aa  1033    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0556311 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2268  hypothetical protein  59.96 
 
 		 514 aa  620  1e-176  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1987  hypothetical protein  59.58 
 
 		 514 aa  616  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1875  hypothetical protein  59.77 
 
 		 514 aa  617  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.441836  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2339  protein of unknown function DUF945  45.45 
 
 		 516 aa  443  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2038  hypothetical protein  45.26 
 
 		 516 aa  440  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1585  hypothetical protein  43.39 
 
 		 502 aa  436  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1829  hypothetical protein  45.58 
 
 		 514 aa  438  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00725153 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01573  hypothetical protein  43.59 
 
 		 502 aa  437  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2029  protein of unknown function DUF945  43.59 
 
 		 502 aa  437  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0265099  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01583  hypothetical protein  43.59 
 
 		 502 aa  437  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1800  hypothetical protein  43.2 
 
 		 502 aa  434  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1689  hypothetical protein  43.14 
 
 		 502 aa  432  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2016  hypothetical protein  43.14 
 
 		 502 aa  432  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235486  normal  0.970517 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1822  hypothetical protein  43.14 
 
 		 502 aa  432  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615092  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2324  hypothetical protein  43.14 
 
 		 502 aa  431  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1708  protein YdgA  43.06 
 
 		 502 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.366845  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1565  protein YdgA  43.06 
 
 		 502 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.402568  normal  0.107029 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1575  hypothetical protein  42.86 
 
 		 502 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.193495  normal  0.310503 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1634  hypothetical protein  42.86 
 
 		 502 aa  425  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00065712  normal  0.987558 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1877  hypothetical protein  43.06 
 
 		 502 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.710418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2139  protein of unknown function DUF945  42.86 
 
 		 517 aa  397  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.434013  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1903  protein of unknown function DUF945  40.4 
 
 		 514 aa  365  1e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.319398  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4085  hypothetical protein  28.87 
 
 		 476 aa  210  4e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000267659  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4379  hypothetical protein  28.87 
 
 		 476 aa  209  6e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000924151  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4334  hypothetical protein  28.93 
 
 		 476 aa  206  6e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.478027  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4154  hypothetical protein  28.51 
 
 		 476 aa  205  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00208158  hitchhiker  0.0000186661 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4125  protein of unknown function DUF945  28.51 
 
 		 476 aa  205  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5302  hypothetical protein  28.31 
 
 		 476 aa  205  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0147516  normal  0.759699 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03696  hypothetical protein  28.51 
 
 		 476 aa  205  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.142182  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03747  hypothetical protein  28.51 
 
 		 476 aa  205  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.132594  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0176  hypothetical protein  29.9 
 
 		 501 aa  197  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5005  hypothetical protein  28.69 
 
 		 521 aa  192  9e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5451  hypothetical protein  27.38 
 
 		 493 aa  181  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.685296  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1230  hypothetical protein  26.61 
 
 		 502 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747865  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3982  hypothetical protein  25.65 
 
 		 502 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1259  hypothetical protein  26.2 
 
 		 502 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.219495  normal  0.705206 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4188  hypothetical protein  25.88 
 
 		 502 aa  148  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2685  hypothetical protein  24.04 
 
 		 528 aa  73.6  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.2738  normal  0.0170599 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1998  protein of unknown function DUF945  22.42 
 
 		 445 aa  68.6  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2703  hypothetical protein  21.33 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333145  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0999  hypothetical protein  41.3 
 
 		 89 aa  45.1  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.993783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>