17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0881 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0881  sporulation domain-containing protein  100 
 
 
251 aa  500  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.369909 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3174  putative signal peptide protein  49.37 
 
 
228 aa  198  6e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.56163  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3993  sporulation domain-containing protein  48.95 
 
 
243 aa  177  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.176394 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4630  sporulation domain-containing protein  51.39 
 
 
247 aa  169  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.747598  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3342  Sporulation domain protein  45.61 
 
 
243 aa  167  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.796684  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3952  hypothetical protein  37.15 
 
 
219 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4717  putative signal peptide protein  36.97 
 
 
217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525776  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3966  putative signal peptide protein  33.33 
 
 
229 aa  118  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.462545  normal  0.0568968 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0226  putative signal peptide protein  30.71 
 
 
219 aa  77  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000356049 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0262  putative signal peptide protein  31.02 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0172  Sporulation domain protein  32.02 
 
 
259 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0165  Sporulation domain protein  31.47 
 
 
261 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.708881 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0104  putative signal peptide protein  29.77 
 
 
258 aa  53.1  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5199  sporulation domain-containing protein  44.23 
 
 
62 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0693658  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3710  hypothetical protein  31.46 
 
 
242 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.297977 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  28.4 
 
 
2449 aa  43.9  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08640  hypothetical protein  27.69 
 
 
234 aa  42.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000854998  hitchhiker  0.000197864 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>