19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0104 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0104  putative signal peptide protein  100 
 
 		 258 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0075  hypothetical protein  55.41 
 
 		 264 aa  225  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0165  Sporulation domain protein  41.53 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.708881 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0172  Sporulation domain protein  39.17 
 
 		 259 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0310  putative signal peptide protein  38.27 
 
 		 272 aa  138  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3966  putative signal peptide protein  27.4 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.462545  normal  0.0568968 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3174  putative signal peptide protein  28.91 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.56163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3710  hypothetical protein  35.53 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297977 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4717  putative signal peptide protein  29.55 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2631  hypothetical protein  34.72 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0818  hypothetical protein  34.62 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349242  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2079  hypothetical protein  31.78 
 
 		 218 aa  52.4  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.664672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08640  hypothetical protein  33.1 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000854998  hitchhiker  0.000197864 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3993  sporulation domain-containing protein  31.74 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.176394 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3655  Sporulation domain protein  35.71 
 
 		 290 aa  46.6  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116691  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3342  Sporulation domain protein  31.74 
 
 		 243 aa  46.2  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.796684  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4228  hypothetical protein  41.79 
 
 		 79 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.198207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0488  hypothetical protein  41.33 
 
 		 79 aa  43.9  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0326515 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0235  Sporulation domain protein  26.83 
 
 		 282 aa  43.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>