17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3342 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3342  Sporulation domain protein  100 
 
 		 243 aa  472  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.796684  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3993  sporulation domain-containing protein  97.84 
 
 		 243 aa  384  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.176394 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3174  putative signal peptide protein  57.89 
 
 		 228 aa  242  5e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.56163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4630  sporulation domain-containing protein  61.79 
 
 		 247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.747598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0881  sporulation domain-containing protein  49 
 
 		 251 aa  195  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369909 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3952  hypothetical protein  46.09 
 
 		 219 aa  171  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3966  putative signal peptide protein  38.89 
 
 		 229 aa  152  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.462545  normal  0.0568968 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4717  putative signal peptide protein  40.87 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0226  putative signal peptide protein  34.54 
 
 		 219 aa  91.3  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000356049 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0262  putative signal peptide protein  33.89 
 
 		 235 aa  72  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0104  putative signal peptide protein  32.61 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0165  Sporulation domain protein  32.05 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.708881 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0172  Sporulation domain protein  32 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0075  hypothetical protein  30.87 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3710  hypothetical protein  28.98 
 
 		 242 aa  50.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297977 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5199  sporulation domain-containing protein  48.08 
 
 		 62 aa  49.7  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0693658  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0310  putative signal peptide protein  29.87 
 
 		 272 aa  42.7  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>