16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3966 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3966  putative signal peptide protein  100 
 
 		 229 aa  457  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.462545  normal  0.0568968 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4717  putative signal peptide protein  56.74 
 
 		 217 aa  222  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3952  hypothetical protein  47.39 
 
 		 219 aa  172  5e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3174  putative signal peptide protein  42.86 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.56163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3993  sporulation domain-containing protein  37.71 
 
 		 243 aa  144  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.176394 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3342  Sporulation domain protein  38.2 
 
 		 243 aa  139  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.796684  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4630  sporulation domain-containing protein  37.35 
 
 		 247 aa  122  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.747598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0881  sporulation domain-containing protein  33.33 
 
 		 251 aa  122  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369909 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0226  putative signal peptide protein  34.63 
 
 		 219 aa  99  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000356049 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0262  putative signal peptide protein  31.32 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0104  putative signal peptide protein  27.4 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0075  hypothetical protein  27.73 
 
 		 264 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0172  Sporulation domain protein  28.7 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0165  Sporulation domain protein  27.82 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.708881 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0310  putative signal peptide protein  24.66 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5199  sporulation domain-containing protein  40 
 
 		 62 aa  46.2  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0693658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>