15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0165 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0165  Sporulation domain protein  100 
 
 		 261 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.708881 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0172  Sporulation domain protein  90.5 
 
 		 259 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0310  putative signal peptide protein  63.82 
 
 		 272 aa  273  3e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0104  putative signal peptide protein  42.5 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0075  hypothetical protein  39.11 
 
 		 264 aa  129  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3710  hypothetical protein  35.54 
 
 		 242 aa  68.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297977 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3655  Sporulation domain protein  37.01 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116691  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3174  putative signal peptide protein  30.53 
 
 		 228 aa  62  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.56163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2079  hypothetical protein  37.5 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.664672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3966  putative signal peptide protein  28.51 
 
 		 229 aa  53.1  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.462545  normal  0.0568968 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2631  hypothetical protein  38.57 
 
 		 215 aa  52.8  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2401  sporulation domain-containing protein  26.17 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4717  putative signal peptide protein  32.17 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0462  hypothetical protein  31.76 
 
 		 214 aa  43.1  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08640  hypothetical protein  35.66 
 
 		 234 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000854998  hitchhiker  0.000197864 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>