19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2401 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2401  sporulation domain-containing protein  100 
 
 
221 aa  442  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0917  hypothetical protein  38.1 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000260853  hitchhiker  0.00000167824 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08640  hypothetical protein  31.19 
 
 
234 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000854998  hitchhiker  0.000197864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0818  hypothetical protein  30.35 
 
 
234 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349242  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3924  sporulation domain-containing protein  30.39 
 
 
225 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1779  hypothetical protein  26 
 
 
237 aa  64.7  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0715873  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02845  hypothetical protein  31.97 
 
 
306 aa  64.3  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0235  Sporulation domain protein  33.06 
 
 
282 aa  63.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06070  hypothetical protein  35.78 
 
 
144 aa  61.6  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4290  sporulation domain-containing protein  26.82 
 
 
234 aa  56.6  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000142012  hitchhiker  0.00000290664 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1138  sporulation domain-containing protein  28.49 
 
 
210 aa  56.6  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0704  hypothetical protein  30.06 
 
 
214 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000345617  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0462  hypothetical protein  33.9 
 
 
214 aa  50.1  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2079  hypothetical protein  27.41 
 
 
218 aa  50.1  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.664672  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3710  hypothetical protein  29.29 
 
 
242 aa  48.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.297977 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0172  Sporulation domain protein  26.87 
 
 
259 aa  45.4  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1231  hypothetical protein  27.64 
 
 
160 aa  45.1  0.0009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3655  Sporulation domain protein  33.94 
 
 
290 aa  44.3  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116691  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0165  Sporulation domain protein  28.67 
 
 
261 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.708881 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>