16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0172 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0172  Sporulation domain protein  100 
 
 		 259 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0165  Sporulation domain protein  90.76 
 
 		 261 aa  431  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.708881 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0310  putative signal peptide protein  63.33 
 
 		 272 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0104  putative signal peptide protein  40.93 
 
 		 258 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0075  hypothetical protein  36.99 
 
 		 264 aa  129  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3655  Sporulation domain protein  37.8 
 
 		 290 aa  68.9  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116691  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3710  hypothetical protein  35.54 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297977 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3174  putative signal peptide protein  32.59 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.56163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3966  putative signal peptide protein  28.7 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.462545  normal  0.0568968 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2079  hypothetical protein  36.07 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.664672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2631  hypothetical protein  38.57 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2401  sporulation domain-containing protein  26.89 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4717  putative signal peptide protein  30.43 
 
 		 217 aa  45.4  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0818  hypothetical protein  35.04 
 
 		 234 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349242  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0462  hypothetical protein  31.1 
 
 		 214 aa  43.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08640  hypothetical protein  36.36 
 
 		 234 aa  42  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000854998  hitchhiker  0.000197864 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>