27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0818 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0818  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  473  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349242  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08640  hypothetical protein  89.79 
 
 
234 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000854998  hitchhiker  0.000197864 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3924  sporulation domain-containing protein  56.65 
 
 
225 aa  238  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06070  hypothetical protein  55 
 
 
144 aa  141  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0917  hypothetical protein  34.33 
 
 
223 aa  103  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000260853  hitchhiker  0.00000167824 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4562  hypothetical protein  41.09 
 
 
142 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00149977  normal  0.65254 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0612  hypothetical protein  41.09 
 
 
142 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.653535  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2401  sporulation domain-containing protein  30.35 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5094  hypothetical protein  40.58 
 
 
146 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000148168  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4764  hypothetical protein  48.11 
 
 
141 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000255391  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0469  hypothetical protein  45.19 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.101572  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1779  hypothetical protein  27.52 
 
 
237 aa  67  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0715873  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0472  hypothetical protein  44.23 
 
 
141 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000830985  normal  0.0146685 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0439  hypothetical protein  44.23 
 
 
154 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000459183  unclonable  0.000000225098 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4290  sporulation domain-containing protein  23.39 
 
 
234 aa  56.6  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000142012  hitchhiker  0.00000290664 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0104  putative signal peptide protein  34.62 
 
 
258 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0704  hypothetical protein  27.81 
 
 
214 aa  52.8  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000345617  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0075  hypothetical protein  32.37 
 
 
264 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2631  hypothetical protein  35.9 
 
 
215 aa  50.8  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3655  Sporulation domain protein  35.71 
 
 
290 aa  48.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116691  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2079  hypothetical protein  36.05 
 
 
218 aa  47.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.664672  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3710  hypothetical protein  31.71 
 
 
242 aa  46.6  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.297977 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0172  Sporulation domain protein  35.04 
 
 
259 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0310  putative signal peptide protein  29.2 
 
 
272 aa  45.8  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02845  hypothetical protein  36.59 
 
 
306 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0235  Sporulation domain protein  30.95 
 
 
282 aa  42.4  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0165  Sporulation domain protein  36.15 
 
 
261 aa  41.6  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.708881 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>