17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3174 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3174  putative signal peptide protein  100 
 
 
228 aa  453  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.56163  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3342  Sporulation domain protein  57.39 
 
 
243 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.796684  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3993  sporulation domain-containing protein  54.35 
 
 
243 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.176394 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4630  sporulation domain-containing protein  54.66 
 
 
247 aa  202  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.747598  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0881  sporulation domain-containing protein  48.21 
 
 
251 aa  201  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.369909 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4717  putative signal peptide protein  46.51 
 
 
217 aa  168  7e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525776  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3952  hypothetical protein  46.75 
 
 
219 aa  164  8e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3966  putative signal peptide protein  42.86 
 
 
229 aa  156  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.462545  normal  0.0568968 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0226  putative signal peptide protein  35.91 
 
 
219 aa  99  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000356049 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0262  putative signal peptide protein  31.15 
 
 
235 aa  68.6  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0172  Sporulation domain protein  31.7 
 
 
259 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0104  putative signal peptide protein  28.91 
 
 
258 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0165  Sporulation domain protein  29.6 
 
 
261 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.708881 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0075  hypothetical protein  30.19 
 
 
264 aa  48.5  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5199  sporulation domain-containing protein  47.46 
 
 
62 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0693658  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3710  hypothetical protein  42.03 
 
 
242 aa  43.1  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.297977 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0310  putative signal peptide protein  26.92 
 
 
272 aa  42.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>