15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0462 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0462  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  431  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2079  hypothetical protein  28.12 
 
 
218 aa  88.2  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.664672  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3710  hypothetical protein  33.95 
 
 
242 aa  68.6  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.297977 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3655  Sporulation domain protein  33.33 
 
 
290 aa  65.5  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116691  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2401  sporulation domain-containing protein  33.9 
 
 
221 aa  61.6  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2631  hypothetical protein  26.62 
 
 
215 aa  52.4  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0172  Sporulation domain protein  31.85 
 
 
259 aa  48.5  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0165  Sporulation domain protein  31.14 
 
 
261 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.708881 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0075  hypothetical protein  31.3 
 
 
264 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0704  hypothetical protein  42.68 
 
 
214 aa  44.3  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000345617  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0104  putative signal peptide protein  28.31 
 
 
258 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0917  hypothetical protein  24.14 
 
 
223 aa  43.1  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000260853  hitchhiker  0.00000167824 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0818  hypothetical protein  25.42 
 
 
234 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349242  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08640  hypothetical protein  27.5 
 
 
234 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000854998  hitchhiker  0.000197864 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0310  putative signal peptide protein  31.58 
 
 
272 aa  42.4  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>