17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3710 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3710  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  479  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297977 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3655  Sporulation domain protein  35.88 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116691  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0165  Sporulation domain protein  29.18 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.708881 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0172  Sporulation domain protein  29.06 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0462  hypothetical protein  29.55 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2079  hypothetical protein  29.14 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.664672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0104  putative signal peptide protein  35.53 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0310  putative signal peptide protein  31.25 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0075  hypothetical protein  36.49 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2401  sporulation domain-containing protein  27.54 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2631  hypothetical protein  31.07 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08640  hypothetical protein  32.93 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000854998  hitchhiker  0.000197864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0818  hypothetical protein  31.71 
 
 		 234 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349242  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0881  sporulation domain-containing protein  27.57 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369909 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3174  putative signal peptide protein  42.03 
 
 		 228 aa  43.5  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.56163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3924  sporulation domain-containing protein  25.98 
 
 		 225 aa  42  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3993  sporulation domain-containing protein  26.15 
 
 		 243 aa  41.6  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.176394 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>