14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0262 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0262  putative signal peptide protein  100 
 
 		 235 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0226  putative signal peptide protein  36.13 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000356049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0881  sporulation domain-containing protein  33.08 
 
 		 251 aa  99  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369909 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3952  hypothetical protein  37.13 
 
 		 219 aa  86.3  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3993  sporulation domain-containing protein  31.67 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.176394 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3174  putative signal peptide protein  31.86 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.56163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4717  putative signal peptide protein  31.82 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3966  putative signal peptide protein  32.29 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.462545  normal  0.0568968 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3342  Sporulation domain protein  33.89 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.796684  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4630  sporulation domain-containing protein  35.51 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.747598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0104  putative signal peptide protein  26.64 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0165  Sporulation domain protein  28.69 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.708881 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5199  sporulation domain-containing protein  46.15 
 
 		 62 aa  46.2  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0693658  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0172  Sporulation domain protein  26.09 
 
 		 259 aa  45.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>