123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1602 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1602  twin arginine-targeting protein translocase  100 
 
 
65 aa  123  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0332589  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1348  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  90.77 
 
 
65 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.171234  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1484  sec-independent protein translocase TatA/TatE  96.92 
 
 
65 aa  70.9  0.000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00562188  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0781  twin arginine-targeting protein translocase  54 
 
 
59 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38742  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1332  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.38 
 
 
71 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1896  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.78 
 
 
87 aa  54.7  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.431023  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0941  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  54 
 
 
55 aa  54.7  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2527  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.38 
 
 
71 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.190921  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2623  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.38 
 
 
71 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2333  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.98 
 
 
87 aa  54.3  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.192204  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3384  twin arginine translocase protein A  60 
 
 
56 aa  53.9  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0040  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  49.02 
 
 
74 aa  53.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.620384  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0191  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.28 
 
 
62 aa  53.1  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0104423  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0917  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  45.16 
 
 
62 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1063  Sec-independent protein translocase TatA  48 
 
 
60 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0562008 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  41.94 
 
 
84 aa  52.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1671  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.32 
 
 
79 aa  52  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03820  twin-arginine translocation protein, TatA subunit  38.98 
 
 
60 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1290  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.38 
 
 
57 aa  50.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2132  twin arginine translocase protein A  46.27 
 
 
66 aa  50.8  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0503  twin arginine-targeting protein translocase  36.92 
 
 
79 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1849  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  33.33 
 
 
69 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  45.24 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3898  twin arginine-targeting protein translocase  35.38 
 
 
79 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0416  twin arginine-targeting protein translocase  35.38 
 
 
79 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0428  twin arginine-targeting protein translocase  35.38 
 
 
79 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000041421 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0442  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  35.38 
 
 
79 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3728  twin arginine-targeting protein translocase  33.85 
 
 
85 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0190  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 
63 aa  47.8  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000115386  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2334  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40 
 
 
94 aa  47.4  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.396798  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4202  Sec-independent protein translocase protein TatA  35.38 
 
 
88 aa  47  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3554  twin arginine-targeting protein translocase  35.38 
 
 
85 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0402  twin arginine-targeting protein translocase  35.38 
 
 
85 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0666  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  42.86 
 
 
214 aa  47  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1795  twin-arginine translocation protein TatA/E  40 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1964  twin arginine-targeting protein translocase  46.15 
 
 
92 aa  47  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.485465 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3376  twin arginine-targeting protein translocase  36.92 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0852423  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0289  twin arginine translocase protein A  52.17 
 
 
63 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4099  twin arginine-targeting protein translocase  36.92 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.966415 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0524  twin arginine-targeting protein translocase  35.82 
 
 
83 aa  46.2  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.897575 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0997  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  38.64 
 
 
50 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150728  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3190  twin arginine-targeting protein translocase  57.5 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0244  twin-arginine translocation protein TatA/E  41.18 
 
 
56 aa  45.8  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.317121  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3217  twin-arginine translocation protein TatA/E  56.1 
 
 
61 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.6697199999999997e-20  hitchhiker  0.000106815 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1347  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  64.58 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.11286  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2435  twin arginine-targeting protein translocase  46.15 
 
 
69 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.216747 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0148  twin arginine translocase protein A  68.97 
 
 
63 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0132  twin arginine translocase protein A  68.97 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0534  Sec-independent protein translocase TatA  42 
 
 
100 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3682  twin arginine-targeting protein translocase  36.67 
 
 
60 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000036766  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1483  sec-independent protein translocase TatA/TatE  60.42 
 
 
78 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0365447  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1601  twin arginine-targeting protein translocase  60.42 
 
 
78 aa  45.1  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0696474  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0228  twin arginine-targeting protein translocase  45.65 
 
 
73 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.055536  normal  0.409471 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2429  twin arginine translocase protein A  35.29 
 
 
82 aa  44.7  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3795  twin arginine-targeting protein translocase  41.51 
 
 
89 aa  44.3  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743518  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0152  mttA/Hcf106 family protein  35.85 
 
 
55 aa  44.3  0.0006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3547  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.74 
 
 
64 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00015351  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3957  twin arginine translocase protein A  35.71 
 
 
84 aa  43.9  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0707519 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2607  twin arginine-targeting protein translocase  40 
 
 
107 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181166  normal  0.0738114 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1948  twin arginine-targeting protein translocase  46.81 
 
 
55 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.7 
 
 
92 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0994  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  36.36 
 
 
50 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.916069  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0472  twin arginine-targeting protein translocase  30.77 
 
 
81 aa  43.5  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1972  twin arginine-targeting protein translocase  38.33 
 
 
86 aa  43.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113539  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1396  twin arginine-targeting protein translocase  50.94 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.419367  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1095  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40.48 
 
 
207 aa  43.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4869  twin arginine-targeting protein translocase  38 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167987  normal  0.115935 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  39.34 
 
 
91 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.34 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.74 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3837  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.86 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.669997 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  39.34 
 
 
91 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03729  twin arginate translocase protein A  35.71 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4143  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  35.71 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0981  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  35 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.34 
 
 
90 aa  42.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0166  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  55.81 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.32799  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0395  twin arginine-targeting protein translocase  31.67 
 
 
71 aa  42  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0782971  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0405  twin arginine-targeting protein translocase  31.67 
 
 
71 aa  42  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.019238  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4060  twin arginine translocase protein A  35.71 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4357  twin arginine translocase protein A  35.71 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0544  twin arginine-targeting protein translocase  37.93 
 
 
73 aa  42.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0291571  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1119  twin arginine-targeting protein translocase  53.49 
 
 
83 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4172  twin arginine translocase protein A  35.71 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121429 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4219  twin arginine translocase protein A  35.71 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000534465 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4308  twin arginine translocase protein A  35.71 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  34.85 
 
 
88 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4253  twin arginine translocase protein A  32.81 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4300  twin arginine translocase protein A  32.81 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111874  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4181  twin arginine translocase protein A  32.81 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4204  twin arginine translocase protein A  32.81 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4360  twin arginine translocase protein A  32.81 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5277  twin arginine translocase protein A  35.71 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.274389  normal  0.174664 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2641  twin arginine translocase protein A  42.59 
 
 
57 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2560  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.11 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.835870000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4849  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  39.29 
 
 
56 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00272525  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03678  hypothetical protein  35.71 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  35.94 
 
 
111 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.85 
 
 
113 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3205  Sec-independent protein translocase protein TatA  42.86 
 
 
77 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>