36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1483 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1483  sec-independent protein translocase TatA/TatE  100 
 
 		 78 aa  149  1e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0365447  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1601  twin arginine-targeting protein translocase  98.72 
 
 		 78 aa  146  9e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0696474  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1347  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  97.44 
 
 		 78 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.11286  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2623  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  39.53 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0994  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  37.5 
 
 		 50 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.916069  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1332  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  39.53 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2527  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  39.53 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.190921  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3942  twin arginine-targeting protein translocase  35.21 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3638  Sec-independent protein translocase protein TatA  35.21 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0274  twin arginine-targeting protein translocase TatA  35.21 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1005  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  33.78 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1671  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.22 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0997  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  37.5 
 
 		 50 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150728  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3682  twin arginine-targeting protein translocase  36 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000036766  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1348  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  57.45 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.171234  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1896  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  34.15 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.431023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03820  twin-arginine translocation protein, TatA subunit  32.65 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0244  twin-arginine translocation protein TatA/E  38.46 
 
 		 56 aa  42.4  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.317121  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1964  twin arginine-targeting protein translocase  37.5 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.485465 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.17 
 
 		 113 aa  41.6  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  35.42 
 
 		 84 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0040  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  38.18 
 
 		 74 aa  42  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.620384  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2132  twin arginine translocase protein A  34.72 
 
 		 66 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1987  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  32.86 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283995  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2334  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  29.63 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.396798  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1290  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  34.69 
 
 		 57 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1435  hypothetical protein  36.67 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0152  mttA/Hcf106 family protein  33.33 
 
 		 55 aa  40.8  0.006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02761  Sec-independent protein secretion pathway component  42.86 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.226319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0544  twin arginine-targeting protein translocase  39.34 
 
 		 73 aa  40.8  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0291571  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1484  sec-independent protein translocase TatA/TatE  63.41 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00562188  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03791  twin arginine translocase protein A  34.78 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0925583  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  43.48 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_002936  DET1602  twin arginine-targeting protein translocase  63.41 
 
 		 65 aa  40  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0332589  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1095  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  37.5 
 
 		 207 aa  40  0.01  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2684  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  27.91 
 
 		 97 aa  40  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.388959  normal  0.165682 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>