162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0228 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0228  twin arginine-targeting protein translocase  100 
 
 		 73 aa  144  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.055536  normal  0.409471 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1063  Sec-independent protein translocase TatA  62.79 
 
 		 60 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0562008 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0781  twin arginine-targeting protein translocase  62.79 
 
 		 59 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38742  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0941  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  52.17 
 
 		 55 aa  60.5  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2132  twin arginine translocase protein A  43.94 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  58.14 
 
 		 84 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  57.5 
 
 		 90 aa  57.4  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1671  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  57.14 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3547  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.02 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00015351  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1896  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  58.54 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.431023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  57.5 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  55 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  55.56 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  60 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.03 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2333  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  44 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.192204  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2334  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  45.76 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.396798  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  55.56 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3384  twin arginine translocase protein A  52.27 
 
 		 56 aa  53.9  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1795  twin-arginine translocation protein TatA/E  39.73 
 
 		 81 aa  53.5  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  57.5 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0191  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  58.33 
 
 		 62 aa  53.1  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0104423  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  57.5 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1435  hypothetical protein  33.85 
 
 		 71 aa  53.1  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1290  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  52.17 
 
 		 57 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  52.5 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0231  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  64.1 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.74798e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1332  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  52 
 
 		 71 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2527  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  52 
 
 		 71 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.190921  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03791  twin arginine translocase protein A  42.11 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0925583  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2623  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  52 
 
 		 71 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  47.92 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1117  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  43.75 
 
 		 115 aa  51.2  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.18 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1128  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  50 
 
 		 55 aa  51.2  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  42.86 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  47.92 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  40.32 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0787  twin arginine-targeting protein translocase  46.51 
 
 		 57 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.423704  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  45.83 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1948  twin arginine-targeting protein translocase  50.98 
 
 		 55 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2080  twin arginine translocase protein A  53.66 
 
 		 77 aa  49.7  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3134  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  52.27 
 
 		 55 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3682  twin arginine-targeting protein translocase  38.89 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000036766  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0917  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  61.76 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0190  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  62.86 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000115386  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3049  twin arginine translocase protein A  63.04 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2067  twin arginine translocase protein A  52.17 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000287314  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2269  twin arginine translocase protein A  52.17 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75681e-36 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2272  twin arginine translocase protein A  52.17 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000018794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2088  twin arginine translocase protein A  52.17 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777407  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2028  twin arginine translocase protein A  52.17 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2026  twin arginine translocase protein A  52.17 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000580487  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0264  twin arginine translocase protein A  51.22 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2242  twin arginine translocase protein A  52.17 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000411362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3099  twin arginine translocase protein A  52.17 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374823  hitchhiker  2.75028e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2354  twin arginine translocase protein A  52.17 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000108072  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  60 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2225  twin arginine translocase protein A  52.17 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000148535  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24611  twin arginine translocase protein A  50 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10686  Tat family transporter: pH-dependent thylakoid protein export into thylakoid  56.41 
 
 		 55 aa  48.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0188  twin arginine-targeting protein translocase  51.11 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623518  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02761  Sec-independent protein secretion pathway component  40.32 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.226319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2560  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  52.78 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.835870000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1972  twin arginine-targeting protein translocase  33.8 
 
 		 86 aa  47.8  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113539  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1278  Sec-independent protein translocase TatA  59.09 
 
 		 73 aa  47.8  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0109777  hitchhiker  0.00000252177 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0544  twin arginine-targeting protein translocase  30 
 
 		 73 aa  47.4  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0291571  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03820  twin-arginine translocation protein, TatA subunit  40.74 
 
 		 60 aa  47.4  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1119  twin arginine-targeting protein translocase  62.5 
 
 		 83 aa  47  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0116  twin arginine translocase protein A  37.93 
 
 		 73 aa  47  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2379  twin arginine-targeting protein translocase  46.51 
 
 		 55 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0329124  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0289  twin arginine translocase protein A  51.67 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0040  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  38.33 
 
 		 74 aa  46.2  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.620384  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3190  twin arginine-targeting protein translocase  55.77 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1749  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  49.02 
 
 		 58 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1201  twin arginine translocase protein A  60.87 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1725  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  49.02 
 
 		 58 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1964  twin arginine-targeting protein translocase  44.9 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.485465 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3420  twin arginine-targeting protein translocase  38.71 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.984089  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3837  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  52.78 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.669997 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1519  twin arginine-targeting protein translocase  42.5 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.085933  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3518  twin arginine translocase protein A  50 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000524898  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  48.89 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1094  twin arginine-targeting protein translocase  38.33 
 
 		 83 aa  44.7  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.58 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1023  twin arginine-targeting protein translocase  40.43 
 
 		 59 aa  44.3  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3587  twin arginine translocase protein A  50 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0060  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40.48 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554164  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0115  twin arginine translocase protein A  36.21 
 
 		 73 aa  44.3  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0244  twin-arginine translocation protein TatA/E  50 
 
 		 56 aa  43.9  0.0007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.317121  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2549  Sec-independent protein translocase TatA  44.19 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.130237  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3217  twin-arginine translocation protein TatA/E  56.86 
 
 		 61 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.6697199999999997e-20  hitchhiker  0.000106815 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0166  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  64.29 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.32799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40.48 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3836  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  44 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.647162 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40.48 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1617  twin-arginine translocation protein TatA/E  42.5 
 
 		 71 aa  43.5  0.0009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1592  twin arginine translocase protein A  58.54 
 
 		 64 aa  43.5  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.387481 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0045  twin arginine translocase protein A  60 
 
 		 61 aa  43.5  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.895264  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03291  hypothetical protein  42.5 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.58964  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>