103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0664 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0664  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  547  1e-155  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0518  3D domain protein  47.52 
 
 		 263 aa  241  7.999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.187039  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0535  3D domain protein  34.23 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418011  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1049  3D domain protein  35.63 
 
 		 145 aa  58.5  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0068  3D domain-containing protein  26.42 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1828  3D domain protein  38.67 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.937918  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1485  hypothetical protein  30.81 
 
 		 337 aa  55.8  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0902184  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1755  3D/G5 domain-containing protein  30.81 
 
 		 337 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0155865  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5061  hypothetical protein  36.79 
 
 		 208 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4744  3D domain-containing protein  35.78 
 
 		 219 aa  52.8  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0651  hypothetical protein  42.86 
 
 		 420 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0595  hypothetical protein  42.86 
 
 		 420 aa  50.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0685  hypothetical protein  42.86 
 
 		 420 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00231685  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2880  3D domain protein  34.26 
 
 		 236 aa  50.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2393  3D domain-containing protein  38.3 
 
 		 297 aa  49.3  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0033  3D domain protein  38.3 
 
 		 401 aa  49.3  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0051  hypothetical protein  35.9 
 
 		 295 aa  48.9  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000966472 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2112  3D domain protein  53.33 
 
 		 347 aa  48.9  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.300796  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0050  hypothetical protein  27.78 
 
 		 322 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000119659 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5723  3D domain-containing protein  29.67 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.916273 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0438  3D domain-containing protein  38.61 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1491  3D domain protein  36.56 
 
 		 285 aa  48.1  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0812  hypothetical protein  38.46 
 
 		 427 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.791616  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0716  hypothetical protein  36.92 
 
 		 423 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.663265  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0109  3D domain protein  41.67 
 
 		 473 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472603  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2093  hypothetical protein  36.63 
 
 		 352 aa  47  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00901653  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0599  3D domain-containing protein  35.16 
 
 		 431 aa  46.6  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0740  hypothetical protein  35.16 
 
 		 424 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000128558 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0035  3D domain protein  31.91 
 
 		 406 aa  47  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.686039  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0108  membrane-bound lytic murein transglycosylase  39.13 
 
 		 502 aa  46.6  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0364059 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0070  3D domain protein  33.6 
 
 		 389 aa  46.6  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000504342  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0752  hypothetical protein  35.16 
 
 		 427 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.861863  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0574  3D domain-containing protein  37.1 
 
 		 416 aa  46.2  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4620  hypothetical protein  36.92 
 
 		 424 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944224 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0051  hypothetical protein  38.36 
 
 		 320 aa  45.8  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000984601  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3534  3D domain-containing protein  35.78 
 
 		 219 aa  45.8  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3815  hypothetical protein  31.72 
 
 		 316 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00183753  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0118  MltA  37.68 
 
 		 500 aa  45.4  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0425257  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3005  hypothetical protein  37.35 
 
 		 570 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0520915  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2756  hypothetical protein  37.35 
 
 		 440 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00725843  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2705  hypothetical protein  37.35 
 
 		 524 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0596  hypothetical protein  36.92 
 
 		 419 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2684  hypothetical protein  37.35 
 
 		 524 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0188967  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2967  hypothetical protein  37.35 
 
 		 440 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000478189  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1437  3D domain-containing protein  56.76 
 
 		 410 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00168198  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2842  3D/G5 domain-containing protein  49.06 
 
 		 340 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1243  hypothetical protein  56.76 
 
 		 410 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.015154  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2528  3D/G5 domain-containing protein  28.76 
 
 		 340 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3773  3D domain-containing protein  35.71 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2759  3D domain-containing protein  37.35 
 
 		 575 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00579221  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2968  enterotoxin  34.38 
 
 		 529 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3608  LysM domain protein, putative  28.04 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1487  hypothetical protein  31.72 
 
 		 310 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000144613  hitchhiker  0.00534322 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2273  enterotoxin  37.35 
 
 		 500 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0333544 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2964  enterotoxin  37.35 
 
 		 488 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000376462 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0170  3D domain protein  35.65 
 
 		 356 aa  44.7  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3743  hypothetical protein  34.82 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00197762  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4828  MltA domain-containing protein  41.82 
 
 		 435 aa  44.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.368727  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3025  3D domain protein  30.7 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1557  peptidoglycan-binding LysM  34.86 
 
 		 517 aa  44.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3009  enterotoxin  37.35 
 
 		 548 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1500  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3562  hypothetical protein  39.29 
 
 		 310 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0820775  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3845  hypothetical protein  39.29 
 
 		 310 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00016497  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  33.33 
 
 		 204 aa  43.9  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1561  MltA domain-containing protein  44.07 
 
 		 387 aa  43.9  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0044  3D domain-containing protein  30.65 
 
 		 338 aa  43.9  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.991775  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1680  MltA domain protein  42.37 
 
 		 383 aa  43.5  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3766  hypothetical protein  39.29 
 
 		 310 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000229315  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1840  MltA domain protein  44.07 
 
 		 418 aa  43.9  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290365  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0069  3D domain protein  44 
 
 		 282 aa  43.9  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000398521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3475  enterotoxin/cell wall-binding protein  39.29 
 
 		 311 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0617059  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0070  3D domain-containing protein  51.16 
 
 		 309 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0155  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  36.76 
 
 		 543 aa  43.5  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3112  MltA domain-containing protein  33.82 
 
 		 382 aa  43.5  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5152  MltA domain protein  37.68 
 
 		 382 aa  43.5  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.05 
 
 		 1155 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3461  enterotoxin/cell-wall binding protein  39.29 
 
 		 310 aa  43.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000115171  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3481  3D domain-containing protein  36.17 
 
 		 321 aa  43.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00402969  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.27 
 
 		 1149 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5592  hypothetical protein  33.67 
 
 		 292 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165295 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3725  hypothetical protein  39.29 
 
 		 310 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9172500000000004e-32 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4920  enterotoxin/cell wall-binding protein  33.67 
 
 		 290 aa  42.7  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4935  enterotoxin/cell wall-binding protein  33.67 
 
 		 294 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4651  MltA domain-containing protein  35 
 
 		 433 aa  42.7  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.05 
 
 		 1155 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5033  3D domain-containing protein  33.67 
 
 		 292 aa  42.7  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5412  hypothetical protein  33.67 
 
 		 290 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5364  hypothetical protein  33.67 
 
 		 292 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0180  hypothetical protein  36.89 
 
 		 208 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5090  hypothetical protein  33.67 
 
 		 290 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5481  hypothetical protein  33.67 
 
 		 290 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0401  membrane-bound lytic murein transglycosylase  36.23 
 
 		 506 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4013  MltA domain-containing protein  40 
 
 		 402 aa  42.7  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5360  hypothetical protein  34.02 
 
 		 338 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1770  3D domain-containing protein  41.27 
 
 		 526 aa  42.4  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.103231  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5330  hypothetical protein  33.67 
 
 		 290 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3987700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5156  hypothetical protein  35.78 
 
 		 208 aa  42  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3363  MltA domain protein  40 
 
 		 380 aa  42  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.894208  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4793  hypothetical protein  35.78 
 
 		 219 aa  42  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>