15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1500 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1500  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  333  7e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2994  hypothetical protein  33.03 
 
 
144 aa  57  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0770  hypothetical protein  31 
 
 
221 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.423376  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2784  hypothetical protein  30.84 
 
 
116 aa  52.4  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.181396  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0044  3D domain-containing protein  31.48 
 
 
338 aa  47  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.991775  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0438  3D domain-containing protein  29.55 
 
 
249 aa  45.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0664  hypothetical protein  33.33 
 
 
270 aa  44.7  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0068  3D domain-containing protein  29.52 
 
 
343 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1015  fibronectin type III domain protein  32.65 
 
 
421 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000062719  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0035  3D domain protein  28.06 
 
 
406 aa  42.4  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.686039  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0033  3D domain protein  30.85 
 
 
401 aa  42.4  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2437  hypothetical protein  32.35 
 
 
192 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000000907911  hitchhiker  0.00000000824452 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0535  3D domain protein  31.48 
 
 
342 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418011  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2814  hypothetical protein  32.35 
 
 
184 aa  41.6  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.018942  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0518  3D domain protein  30.77 
 
 
263 aa  40.8  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.187039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>