16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0770 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0770  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  426  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.423376  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2784  hypothetical protein  52.29 
 
 
116 aa  122  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.181396  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2994  hypothetical protein  48.82 
 
 
144 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2814  hypothetical protein  40 
 
 
184 aa  58.5  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.018942  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2437  hypothetical protein  40 
 
 
192 aa  58.5  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000000907911  hitchhiker  0.00000000824452 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0573  3D domain protein  36.94 
 
 
260 aa  54.3  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1500  hypothetical protein  31 
 
 
160 aa  52.4  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1837  hypothetical protein  32.32 
 
 
140 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.648147  normal  0.199357 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0438  3D domain-containing protein  38.76 
 
 
249 aa  50.8  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5723  3D domain-containing protein  34.21 
 
 
245 aa  48.5  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.916273 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3608  LysM domain protein, putative  34.57 
 
 
245 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2112  3D domain protein  33.94 
 
 
347 aa  47.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.300796  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0068  3D domain-containing protein  31.78 
 
 
343 aa  46.2  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0070  3D domain-containing protein  31.82 
 
 
309 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2093  hypothetical protein  31.53 
 
 
352 aa  42.7  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00901653  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0535  3D domain protein  33.61 
 
 
342 aa  42.4  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>