115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0174 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0174  ChaC-like protein  100 
 
 
194 aa  401  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.331438  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1704  ChaC family protein  64.52 
 
 
196 aa  244  4e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3813  ChaC family protein  62.69 
 
 
191 aa  244  8e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5331  ChaC family protein  51.15 
 
 
178 aa  167  6e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.629174  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1135  cation transporter  46.11 
 
 
172 aa  148  5e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.673266  normal  0.863519 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_13383  predicted protein  41.21 
 
 
193 aa  125  6e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.823077  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2210  ChaC family protein  37.78 
 
 
182 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.956018 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1612  ChaC family protein  39.78 
 
 
178 aa  106  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1406  ChaC family protein  37.93 
 
 
184 aa  103  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.190446  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6012  ChaC family protein  38.6 
 
 
245 aa  102  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296192  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02988  cation transport protein ChaC, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08560)  36.59 
 
 
269 aa  102  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0364999  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2942  putative cation transport protein  35.76 
 
 
180 aa  99  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0771654 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3576  ChaC family protein  38.89 
 
 
176 aa  98.6  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4863  ChaC-like protein  35.47 
 
 
198 aa  98.2  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0372933  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_27149  conserved hypothetical protein  31.51 
 
 
234 aa  97.4  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.503803  normal  0.389081 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1180  putative cation transport protein chaC-related  34.73 
 
 
196 aa  97.1  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3259  ChaC-like protein  37.29 
 
 
180 aa  96.3  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5214  ChaC family protein  36.42 
 
 
192 aa  95.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.608281  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0838  ChaC-like protein  35.12 
 
 
192 aa  94.4  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0947  ChaC-like protein  33.93 
 
 
192 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219888  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2287  ChaC-like protein  34.44 
 
 
182 aa  91.3  9e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.216291  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0963  ChaC family protein  34.44 
 
 
182 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.128703  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1179  ChaC family protein  34.1 
 
 
231 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0580  ChaC-like protein  33.53 
 
 
194 aa  90.1  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4445  ChaC family protein  36.14 
 
 
181 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318121  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0993  ChaC family protein  32.95 
 
 
237 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.321257  normal  0.796007 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1038  ChaC-like protein  36.57 
 
 
180 aa  88.6  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3248  ChaC family protein  34.94 
 
 
181 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0671  ChaC-like protein  32.95 
 
 
194 aa  87.8  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.85299  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3087  ChaC-like protein  32.72 
 
 
177 aa  87.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1586  ChaC family protein  36.31 
 
 
182 aa  87.4  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.672833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1050  ChaC family protein  32.37 
 
 
231 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0448868 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2801  ChaC family protein  33.51 
 
 
187 aa  86.7  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.356438  normal  0.415796 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3223  ChaC family protein  37.85 
 
 
192 aa  86.7  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.770321  normal  0.203555 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1879  ChaC family protein  31.05 
 
 
197 aa  85.9  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.681402  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2056  ChaC family protein  31.05 
 
 
197 aa  85.5  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.013556  normal  0.320486 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2030  ChaC family protein  36.09 
 
 
231 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.625962  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3869  ChaC family protein  35.19 
 
 
176 aa  84.7  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3941  ChaC family protein  32.11 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0236923  normal  0.174216 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2888  ChaC-like protein  33.52 
 
 
228 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.512939 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2097  ChaC-like protein  36.42 
 
 
175 aa  81.3  0.000000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.866958  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1916  putative cation transport protein  32.45 
 
 
190 aa  81.3  0.000000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1991  cation transport protein, putative  32.45 
 
 
186 aa  80.9  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0990  ChaC family protein  33.71 
 
 
192 aa  80.9  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3560  ChaC family protein  34.55 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5792  ChaC family protein  34.73 
 
 
263 aa  77.8  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000625495 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2918  ChaC family protein  33.52 
 
 
246 aa  77.4  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5704  ChaC family protein  31.09 
 
 
225 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.891612 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4031  transporter  32.53 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0409  ChaC family protein  30.22 
 
 
219 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.196689 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2776  ChaC-like protein  31.28 
 
 
258 aa  74.7  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2547  ChaC family protein  34.94 
 
 
189 aa  74.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5034  ChaC family protein  31.32 
 
 
216 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5272  ChaC family protein  31.58 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1701  chaC protein  32.53 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3535  ChaC family protein  33.12 
 
 
174 aa  73.6  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.025306 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2926  uncharacterized protein involved in cation transport  30.36 
 
 
218 aa  72.8  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.426229  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2443  ChaC family protein  33.12 
 
 
252 aa  72.8  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344458  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1326  chaC protein  32.53 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.158462  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2405  ChaC family protein  32.53 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000181734 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1385  chaC protein  32.53 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2428  ChaC family protein  32.53 
 
 
238 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.216984  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06790  conserved hypothetical protein  28.95 
 
 
232 aa  72.4  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0627  putative ChaC-like protein  29.67 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1368  chaC protein  32.53 
 
 
238 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0977707  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1922  chaC protein  32.53 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.522557  normal  0.0428933 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5239  ChaC-related protein  30.54 
 
 
222 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0056  ChaC family protein  35.12 
 
 
247 aa  72  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.857973  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5120  ChaC family protein  31.4 
 
 
216 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01196  regulatory protein for cation transport  31.93 
 
 
238 aa  71.2  0.000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0825  ChaC-like protein  31.46 
 
 
280 aa  71.2  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0341641  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1794  ChaC family protein  33.33 
 
 
224 aa  71.2  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0288596  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01206  hypothetical protein  31.93 
 
 
238 aa  71.2  0.000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0304  ChaC-like protein  29.94 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0705  ChaC family protein  29.12 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.664903  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0602  ChaC family protein  29.12 
 
 
210 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6024  ChaC-like protein  28.41 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12793  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2633  ChaC-like protein  30.23 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0613681  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3332  ChaC family protein  29.12 
 
 
245 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.171445 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4923  ChaC-like protein  30.67 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2330  ChaC family protein  29.1 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2613  ChaC family protein  28.41 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.303262  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3710  ChaC family protein  31.03 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2749  ChaC family protein  28.41 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0164562  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0017  ChaC family protein  32.92 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.189731 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2084  ChaC-like protein  28.41 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.704281  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2696  ChaC family protein  28.41 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0640331  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2724  ChaC family protein  28.41 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1758  ChaC family protein  27.69 
 
 
226 aa  68.6  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0222  ChaC-related protein  28.57 
 
 
210 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0886  hypothetical protein  28.57 
 
 
210 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2724  ChaC family protein  28.57 
 
 
210 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2354  ChaC family protein  28.57 
 
 
210 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0720  ChaC family protein  28.57 
 
 
210 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2434  ChaC family protein  28.57 
 
 
210 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3553  ChaC-like protein  34.91 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.148315  normal  0.245974 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  32.4 
 
 
643 aa  67.8  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5211  ChaC family protein  30.23 
 
 
185 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337451  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5452  ChaC-like protein  30.54 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00716931 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0588  ChaC-related protein  28.02 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>