43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_27149 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_27149  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  485  1e-136  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.503803  normal  0.389081 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02988  cation transport protein ChaC, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08560)  38.56 
 
 		 269 aa  139  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0364999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5331  ChaC family protein  31.47 
 
 		 178 aa  112  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.629174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3813  ChaC family protein  34.75 
 
 		 191 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06790  conserved hypothetical protein  32.49 
 
 		 232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1704  ChaC family protein  31.6 
 
 		 196 aa  106  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0174  ChaC-like protein  31.51 
 
 		 194 aa  97.4  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.331438  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1135  cation transporter  29.03 
 
 		 172 aa  91.3  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.673266  normal  0.863519 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_13383  predicted protein  28.81 
 
 		 193 aa  86.7  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.823077  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1991  cation transport protein, putative  25.97 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1916  putative cation transport protein  25.97 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1586  ChaC family protein  25 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672833 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3576  ChaC family protein  25.64 
 
 		 176 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3223  ChaC family protein  25.86 
 
 		 192 aa  52.8  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.770321  normal  0.203555 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0990  ChaC family protein  23.18 
 
 		 192 aa  53.1  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  24.31 
 
 		 643 aa  52  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2097  ChaC-like protein  30.28 
 
 		 175 aa  50.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.866958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2776  ChaC-like protein  46.15 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3869  ChaC family protein  25.64 
 
 		 176 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1050  ChaC family protein  46.3 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0448868 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1179  ChaC family protein  46.3 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5452  ChaC-like protein  44.23 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00716931 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0580  ChaC-like protein  25 
 
 		 194 aa  46.2  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3087  ChaC-like protein  25.33 
 
 		 177 aa  45.8  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2942  putative cation transport protein  23.08 
 
 		 180 aa  45.8  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0771654 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0993  ChaC family protein  44.64 
 
 		 237 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.321257  normal  0.796007 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1612  ChaC family protein  45.28 
 
 		 178 aa  45.4  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5120  ChaC family protein  44.64 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4445  ChaC family protein  44.23 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318121  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5034  ChaC family protein  44.64 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2030  ChaC family protein  45.28 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.625962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3248  ChaC family protein  30.89 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5272  ChaC family protein  44.64 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0304  ChaC-like protein  41.18 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2918  ChaC family protein  24.05 
 
 		 246 aa  43.5  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2210  ChaC family protein  24.42 
 
 		 182 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.956018 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5239  ChaC-related protein  41.18 
 
 		 222 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1794  ChaC family protein  22.75 
 
 		 224 aa  43.1  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0288596  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0056  ChaC family protein  42.31 
 
 		 247 aa  42.4  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.857973  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5211  ChaC family protein  42.86 
 
 		 185 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3535  ChaC family protein  23.04 
 
 		 174 aa  42  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.025306 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1180  putative cation transport protein chaC-related  22.75 
 
 		 196 aa  41.6  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4031  transporter  23.48 
 
 		 179 aa  41.6  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>