113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0947 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0947  ChaC-like protein  100 
 
 		 192 aa  390  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0838  ChaC-like protein  90.62 
 
 		 192 aa  360  1e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5214  ChaC family protein  83.33 
 
 		 192 aa  328  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.608281  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4863  ChaC-like protein  79.06 
 
 		 198 aa  311  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0372933  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1180  putative cation transport protein chaC-related  79.78 
 
 		 196 aa  298  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0671  ChaC-like protein  79.78 
 
 		 194 aa  291  3e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.85299  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0580  ChaC-like protein  78.77 
 
 		 194 aa  288  3e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3248  ChaC family protein  64.61 
 
 		 181 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4445  ChaC family protein  64.57 
 
 		 181 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318121  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3560  ChaC family protein  61.05 
 
 		 173 aa  199  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1586  ChaC family protein  60.84 
 
 		 182 aa  191  8e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672833 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0017  ChaC family protein  61.85 
 
 		 212 aa  187  7e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.189731 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3087  ChaC-like protein  58.82 
 
 		 177 aa  185  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3535  ChaC family protein  67.11 
 
 		 174 aa  177  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.025306 
 
 
-
 
NC_004310  BR1991  cation transport protein, putative  53.85 
 
 		 186 aa  174  5e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3576  ChaC family protein  52.98 
 
 		 176 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1916  putative cation transport protein  53.25 
 
 		 190 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3869  ChaC family protein  53.57 
 
 		 176 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4031  transporter  52.87 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2547  ChaC family protein  52.51 
 
 		 189 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0990  ChaC family protein  52.07 
 
 		 192 aa  166  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3259  ChaC-like protein  50.6 
 
 		 180 aa  161  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2942  putative cation transport protein  49.15 
 
 		 180 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0771654 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1406  ChaC family protein  48.31 
 
 		 184 aa  147  7e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.190446  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3223  ChaC family protein  45.76 
 
 		 192 aa  140  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.770321  normal  0.203555 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2210  ChaC family protein  44.77 
 
 		 182 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.956018 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0729  ChaC family protein  43.96 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.740634  normal  0.753503 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0799  ChaC family protein  43.96 
 
 		 249 aa  131  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496231  normal  0.444522 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2287  ChaC-like protein  44 
 
 		 182 aa  131  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.216291  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0963  ChaC family protein  43.43 
 
 		 182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.128703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0409  ChaC family protein  45.78 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196689 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3332  ChaC family protein  44.05 
 
 		 245 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.171445 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2776  ChaC-like protein  41.28 
 
 		 258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2801  ChaC family protein  42.94 
 
 		 187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.356438  normal  0.415796 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3941  ChaC family protein  39.52 
 
 		 208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0236923  normal  0.174216 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5351  ChaC family protein  41.72 
 
 		 236 aa  124  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.755468  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0602  ChaC family protein  43.98 
 
 		 210 aa  124  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0222  ChaC-related protein  41.58 
 
 		 210 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0886  hypothetical protein  41.58 
 
 		 210 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0627  putative ChaC-like protein  43.45 
 
 		 237 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2724  ChaC family protein  41.58 
 
 		 210 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2354  ChaC family protein  41.58 
 
 		 210 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0705  ChaC family protein  41.58 
 
 		 210 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.664903  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0720  ChaC family protein  41.58 
 
 		 210 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2434  ChaC family protein  41.58 
 
 		 210 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0782  hypothetical protein  41.86 
 
 		 248 aa  124  9e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.498186  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6024  ChaC-like protein  41.57 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0588  ChaC-related protein  41.58 
 
 		 210 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2613  ChaC family protein  42.13 
 
 		 205 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.303262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1879  ChaC family protein  43.11 
 
 		 197 aa  123  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.681402  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1038  ChaC-like protein  40.7 
 
 		 180 aa  122  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2749  ChaC family protein  42.13 
 
 		 210 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0164562  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1612  ChaC family protein  42.77 
 
 		 178 aa  122  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2056  ChaC family protein  42.51 
 
 		 197 aa  122  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.013556  normal  0.320486 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0304  ChaC-like protein  39.43 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0825  ChaC-like protein  40 
 
 		 280 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0341641  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5239  ChaC-related protein  38.86 
 
 		 222 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2084  ChaC-like protein  41.01 
 
 		 210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.704281  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2696  ChaC family protein  41.01 
 
 		 210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0640331  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2443  ChaC family protein  39.76 
 
 		 252 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2724  ChaC family protein  41.01 
 
 		 210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4923  ChaC-like protein  40.46 
 
 		 247 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2097  ChaC-like protein  39.53 
 
 		 175 aa  118  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.866958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2633  ChaC-like protein  39.2 
 
 		 259 aa  117  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0613681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0993  ChaC family protein  41.07 
 
 		 237 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.321257  normal  0.796007 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5452  ChaC-like protein  40.24 
 
 		 222 aa  115  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00716931 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5034  ChaC family protein  39.63 
 
 		 216 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5272  ChaC family protein  40.24 
 
 		 216 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6012  ChaC family protein  39.76 
 
 		 245 aa  114  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296192  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1179  ChaC family protein  39.89 
 
 		 231 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5120  ChaC family protein  39.63 
 
 		 216 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1050  ChaC family protein  37.88 
 
 		 231 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0448868 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2920  ChaC family protein  39.29 
 
 		 242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.508921 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2988  ChaC family protein  38.6 
 
 		 203 aa  111  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  0.132092 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3710  ChaC family protein  38.51 
 
 		 242 aa  109  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5211  ChaC family protein  38.41 
 
 		 185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5704  ChaC family protein  37.14 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.891612 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2926  uncharacterized protein involved in cation transport  36.67 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.426229  normal  0.932836 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01196  regulatory protein for cation transport  33.93 
 
 		 238 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01206  hypothetical protein  33.93 
 
 		 238 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1922  chaC protein  34.52 
 
 		 231 aa  106  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.522557  normal  0.0428933 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2030  ChaC family protein  38.3 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.625962  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2428  ChaC family protein  34.52 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.216984  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1368  chaC protein  34.52 
 
 		 238 aa  105  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0977707  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3553  ChaC-like protein  37.28 
 
 		 182 aa  104  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.148315  normal  0.245974 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5792  ChaC family protein  37.72 
 
 		 263 aa  105  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000625495 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1326  chaC protein  33.93 
 
 		 238 aa  104  9e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.158462  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2405  ChaC family protein  33.93 
 
 		 238 aa  104  9e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181734 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1385  chaC protein  33.93 
 
 		 238 aa  104  9e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1701  chaC protein  33.94 
 
 		 231 aa  102  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2330  ChaC family protein  32.37 
 
 		 231 aa  99.4  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5575  ChaC family protein  37.23 
 
 		 232 aa  95.9  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.37674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1758  ChaC family protein  33.33 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0174  ChaC-like protein  33.93 
 
 		 194 aa  92.8  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.331438  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1794  ChaC family protein  32.95 
 
 		 224 aa  92  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0288596  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2571  ChaC family protein  32.56 
 
 		 228 aa  92  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2265  ChaC family protein  32.56 
 
 		 228 aa  91.3  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2918  ChaC family protein  33.96 
 
 		 246 aa  90.9  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1214  ChaC family protein  35.33 
 
 		 236 aa  90.1  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.296415  normal  0.688682 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2888  ChaC-like protein  31.74 
 
 		 228 aa  89.4  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.512939 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>