40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC06790 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006685  CNC06790  conserved hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  482  1e-135  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_27149  conserved hypothetical protein  32.49 
 
 
234 aa  110  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.503803  normal  0.389081 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02988  cation transport protein ChaC, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08560)  32.17 
 
 
269 aa  101  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0364999  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5331  ChaC family protein  26.46 
 
 
178 aa  84  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.629174  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3813  ChaC family protein  30.33 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0174  ChaC-like protein  28.95 
 
 
194 aa  72.4  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.331438  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_13383  predicted protein  26.67 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.823077  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1704  ChaC family protein  28.57 
 
 
196 aa  68.2  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1135  cation transporter  50.88 
 
 
172 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.673266  normal  0.863519 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3560  ChaC family protein  25.23 
 
 
173 aa  50.8  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0056  ChaC family protein  25.91 
 
 
247 aa  48.9  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.857973  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1916  putative cation transport protein  31.4 
 
 
190 aa  48.5  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2210  ChaC family protein  23.85 
 
 
182 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.956018 
 
 
-
 
NC_004310  BR1991  cation transport protein, putative  31.4 
 
 
186 aa  48.5  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2097  ChaC-like protein  35.09 
 
 
175 aa  48.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.866958  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1406  ChaC family protein  27.16 
 
 
184 aa  47.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.190446  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1586  ChaC family protein  24.17 
 
 
182 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.672833 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0580  ChaC-like protein  22.86 
 
 
194 aa  46.6  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3576  ChaC family protein  24.11 
 
 
176 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  26.21 
 
 
643 aa  45.8  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3223  ChaC family protein  30.48 
 
 
192 aa  45.8  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.770321  normal  0.203555 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1794  ChaC family protein  26.42 
 
 
224 aa  45.4  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0288596  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3259  ChaC-like protein  29.75 
 
 
180 aa  45.4  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2776  ChaC-like protein  40 
 
 
258 aa  44.7  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2443  ChaC family protein  22.27 
 
 
252 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344458  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5452  ChaC-like protein  47.17 
 
 
222 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00716931 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5034  ChaC family protein  28.67 
 
 
216 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5272  ChaC family protein  28.67 
 
 
216 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5120  ChaC family protein  28.67 
 
 
216 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4863  ChaC-like protein  22.86 
 
 
198 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0372933  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1612  ChaC family protein  23.98 
 
 
178 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3087  ChaC-like protein  31.4 
 
 
177 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1180  putative cation transport protein chaC-related  23.08 
 
 
196 aa  43.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2942  putative cation transport protein  41.27 
 
 
180 aa  43.1  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0771654 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2030  ChaC family protein  38.46 
 
 
231 aa  42.7  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.625962  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0947  ChaC-like protein  22.6 
 
 
192 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219888  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0990  ChaC family protein  30.19 
 
 
192 aa  42.4  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5239  ChaC-related protein  45.28 
 
 
222 aa  42  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0671  ChaC-like protein  21.9 
 
 
194 aa  42  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.85299  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0838  ChaC-like protein  22.6 
 
 
192 aa  41.6  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.382992 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>