115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1135 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1135  cation transporter  100 
 
 		 172 aa  347  3e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.673266  normal  0.863519 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5331  ChaC family protein  52.84 
 
 		 178 aa  181  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.629174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1704  ChaC family protein  49.69 
 
 		 196 aa  164  6.9999999999999995e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0174  ChaC-like protein  46.11 
 
 		 194 aa  148  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.331438  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3813  ChaC family protein  44.97 
 
 		 191 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1050  ChaC family protein  41.42 
 
 		 231 aa  112  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0448868 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4445  ChaC family protein  40.24 
 
 		 181 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318121  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3248  ChaC family protein  40.24 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1179  ChaC family protein  40.24 
 
 		 231 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_13383  predicted protein  37.71 
 
 		 193 aa  107  6e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.823077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0990  ChaC family protein  36.9 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3087  ChaC-like protein  37.28 
 
 		 177 aa  102  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6012  ChaC family protein  40.99 
 
 		 245 aa  101  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296192  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1916  putative cation transport protein  36.47 
 
 		 190 aa  100  7e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1991  cation transport protein, putative  36.47 
 
 		 186 aa  100  9e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02988  cation transport protein ChaC, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08560)  35.78 
 
 		 269 aa  99.8  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0364999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2942  putative cation transport protein  35.63 
 
 		 180 aa  98.2  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0771654 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0993  ChaC family protein  37.28 
 
 		 237 aa  98.2  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.321257  normal  0.796007 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5704  ChaC family protein  38.01 
 
 		 225 aa  97.4  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.891612 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1794  ChaC family protein  36.9 
 
 		 224 aa  96.7  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0288596  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0580  ChaC-like protein  34.71 
 
 		 194 aa  95.5  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3535  ChaC family protein  38.61 
 
 		 174 aa  95.9  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.025306 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2265  ChaC family protein  36.9 
 
 		 228 aa  95.5  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2210  ChaC family protein  36.99 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.956018 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2571  ChaC family protein  36.31 
 
 		 228 aa  92  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_27149  conserved hypothetical protein  29.03 
 
 		 234 aa  91.3  5e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.503803  normal  0.389081 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0838  ChaC-like protein  35.5 
 
 		 192 aa  90.9  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2330  ChaC family protein  34.52 
 
 		 231 aa  91.3  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0671  ChaC-like protein  35.29 
 
 		 194 aa  90.9  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.85299  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2097  ChaC-like protein  33.96 
 
 		 175 aa  90.1  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.866958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1758  ChaC family protein  35.09 
 
 		 226 aa  89.4  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2918  ChaC family protein  36.69 
 
 		 246 aa  89.4  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1180  putative cation transport protein chaC-related  33.91 
 
 		 196 aa  89  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2030  ChaC family protein  37.06 
 
 		 231 aa  87.8  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.625962  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2428  ChaC family protein  34.81 
 
 		 238 aa  87.4  8e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.216984  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0947  ChaC-like protein  34.91 
 
 		 192 aa  87.4  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1368  chaC protein  34.81 
 
 		 238 aa  87.4  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0977707  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1922  chaC protein  34.81 
 
 		 231 aa  87.4  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.522557  normal  0.0428933 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1701  chaC protein  34.81 
 
 		 231 aa  87.4  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3259  ChaC-like protein  36.09 
 
 		 180 aa  86.7  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2888  ChaC-like protein  31.98 
 
 		 228 aa  87.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.512939 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1612  ChaC family protein  34.52 
 
 		 178 aa  86.7  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4863  ChaC-like protein  36.53 
 
 		 198 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0372933  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1406  ChaC family protein  34.52 
 
 		 184 aa  86.3  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.190446  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5214  ChaC family protein  35.4 
 
 		 192 aa  86.3  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.608281  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2547  ChaC family protein  34.3 
 
 		 189 aa  84.7  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1326  chaC protein  34.18 
 
 		 238 aa  84.7  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.158462  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2405  ChaC family protein  34.18 
 
 		 238 aa  84.7  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181734 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1385  chaC protein  34.18 
 
 		 238 aa  84.7  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1586  ChaC family protein  37.42 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672833 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0304  ChaC-like protein  34.36 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0963  ChaC family protein  35.26 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.128703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2287  ChaC-like protein  35.26 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.216291  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5034  ChaC family protein  36.36 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4031  transporter  34.38 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3560  ChaC family protein  34.16 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01196  regulatory protein for cation transport  32.91 
 
 		 238 aa  81.3  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5239  ChaC-related protein  33.74 
 
 		 222 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01206  hypothetical protein  32.91 
 
 		 238 aa  81.3  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5792  ChaC family protein  37.89 
 
 		 263 aa  81.3  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000625495 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2776  ChaC-like protein  36.31 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0017  ChaC family protein  34.88 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.189731 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4148  ChaC family protein  32.16 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5452  ChaC-like protein  33.13 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00716931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3576  ChaC family protein  30.36 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5272  ChaC family protein  35.71 
 
 		 216 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5120  ChaC family protein  35.71 
 
 		 216 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5211  ChaC family protein  35.71 
 
 		 185 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3869  ChaC family protein  31.55 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2084  ChaC-like protein  32.54 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.704281  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2696  ChaC family protein  32.54 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0640331  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2724  ChaC family protein  32.54 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  34.46 
 
 		 643 aa  73.2  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3223  ChaC family protein  30.29 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.770321  normal  0.203555 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5575  ChaC family protein  32.16 
 
 		 232 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.37674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6024  ChaC-like protein  31.95 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0602  ChaC family protein  32.54 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2749  ChaC family protein  31.95 
 
 		 210 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0164562  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2613  ChaC family protein  31.95 
 
 		 205 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.303262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1038  ChaC-like protein  30.68 
 
 		 180 aa  70.9  0.000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2443  ChaC family protein  31.74 
 
 		 252 aa  70.9  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0627  putative ChaC-like protein  32.32 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3332  ChaC family protein  32.12 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.171445 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2926  uncharacterized protein involved in cation transport  31.65 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.426229  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3941  ChaC family protein  31.36 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0236923  normal  0.174216 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0056  ChaC family protein  32.94 
 
 		 247 aa  67.8  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.857973  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0705  ChaC family protein  32.54 
 
 		 210 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.664903  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0222  ChaC-related protein  32.54 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0886  hypothetical protein  32.54 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2724  ChaC family protein  32.54 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2354  ChaC family protein  32.54 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0720  ChaC family protein  32.54 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2434  ChaC family protein  32.54 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0729  ChaC family protein  31.06 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.740634  normal  0.753503 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1879  ChaC family protein  30.46 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.681402  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2633  ChaC-like protein  29.27 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0613681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1214  ChaC family protein  29.48 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.296415  normal  0.688682 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0782  hypothetical protein  31.06 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.498186  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0588  ChaC-related protein  31.95 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0409  ChaC family protein  32.12 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196689 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>