90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3786 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3786  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  100 
 
 		 50 aa  104  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00367379  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3119  flavin reductase-like, FMN-binding  54.76 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1335  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  51.43 
 
 		 221 aa  49.3  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1538  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  36.21 
 
 		 237 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.029752 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1511  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  36.21 
 
 		 237 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1288  flavin reductase-like, FMN-binding  42.86 
 
 		 229 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000609223 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4424  rubrerythrin  42.55 
 
 		 237 aa  47  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1537  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  38 
 
 		 237 aa  46.6  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0402296  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1583  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  43.4 
 
 		 504 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.652829  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0562  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.9 
 
 		 195 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.146358 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  42.55 
 
 		 696 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2210  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  37.5 
 
 		 480 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3167  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  47.73 
 
 		 479 aa  45.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2833  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  47.73 
 
 		 479 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0125184 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1002  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  47.73 
 
 		 479 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0118173  hitchhiker  0.000199326 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3042  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  47.73 
 
 		 479 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0301118 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  47.73 
 
 		 479 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2994  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  47.73 
 
 		 479 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2846  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  47.73 
 
 		 479 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02525  hypothetical protein  47.73 
 
 		 479 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459726  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0677  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.75 
 
 		 53 aa  46.2  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000269222  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1125  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.81 
 
 		 53 aa  45.4  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.228048  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0979  beta-lactamase domain protein  47.73 
 
 		 479 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00228257  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02560  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  47.73 
 
 		 479 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.54657  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2501  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.83 
 
 		 54 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.843854  normal  0.828808 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  43.18 
 
 		 479 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3188  rubredoxin  46.81 
 
 		 52 aa  45.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0869  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.55 
 
 		 52 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000308024  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0847  rubredoxin  45.83 
 
 		 52 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3182  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  47.73 
 
 		 482 aa  44.7  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3149  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  45.45 
 
 		 479 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.540983  normal  0.0409708 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2991  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  45.45 
 
 		 479 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3026  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  45.45 
 
 		 479 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000635155 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2173  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  36.84 
 
 		 415 aa  44.7  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.953962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2461  Glutamate synthase (NADPH)  50 
 
 		 529 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2515  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42 
 
 		 53 aa  43.9  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.310481  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3260  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  45.45 
 
 		 494 aa  43.9  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0437217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0270  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.68 
 
 		 53 aa  43.9  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0460906  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1197  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44 
 
 		 52 aa  43.9  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.1609  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1457  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.68 
 
 		 58 aa  43.9  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.296231  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0272  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.68 
 
 		 53 aa  43.9  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000689971  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0757  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.18 
 
 		 469 aa  43.9  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0090  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.43 
 
 		 52 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2533  rubrerythrin  39.58 
 
 		 237 aa  43.5  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2164  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42 
 
 		 52 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1313  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.9 
 
 		 45 aa  42.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.171893  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1245  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.82 
 
 		 284 aa  42.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0468502  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0750  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.9 
 
 		 52 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000427442 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0147  rubredoxin  46 
 
 		 52 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0175  hypothetical protein  45.65 
 
 		 51 aa  42.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0954  Glutamate synthase (NADPH)  42.11 
 
 		 529 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3171  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.43 
 
 		 52 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000167353  normal  0.561512 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  38.3 
 
 		 696 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0117  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.55 
 
 		 52 aa  42.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.403873  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1551  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.83 
 
 		 50 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00582708 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2653  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42 
 
 		 53 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0735  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.9 
 
 		 52 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0414  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46 
 
 		 52 aa  42  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0784  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  45.45 
 
 		 503 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1021  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  45.45 
 
 		 505 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.527208  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2184  rubrerythrin  40.43 
 
 		 243 aa  41.6  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3496  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.46 
 
 		 520 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1630  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.55 
 
 		 54 aa  42  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0973  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.68 
 
 		 52 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000469593  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4666  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  37.04 
 
 		 444 aa  41.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00796628  normal  0.983667 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3080  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.55 
 
 		 54 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.3234  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2011  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.5 
 
 		 45 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000593389  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3357  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.55 
 
 		 52 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0101  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.68 
 
 		 52 aa  41.2  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000330254  hitchhiker  1.93244e-16 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1473  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  37.5 
 
 		 52 aa  41.6  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3222  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42 
 
 		 52 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.798538  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1052  rubredoxin  40.82 
 
 		 52 aa  41.2  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0144051  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2048  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.43 
 
 		 52 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59994e-22 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3930  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.55 
 
 		 53 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186647 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1308  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  41.3 
 
 		 444 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0972  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.43 
 
 		 476 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.425779 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1149  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  41.3 
 
 		 444 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.751699 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0139  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42 
 
 		 53 aa  40.8  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.43807 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1570  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  36.84 
 
 		 529 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28841  rubredoxin:rubrerythrin:rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  37.5 
 
 		 235 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1311  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  35.71 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.177646  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0937  rubredoxin-related protein  38.6 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.198839  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0875  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  39.58 
 
 		 52 aa  40.4  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000124351  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2713  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.17 
 
 		 227 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.120734 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1729  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.75 
 
 		 54 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1582  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.55 
 
 		 54 aa  40.4  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3344  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.55 
 
 		 52 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000210348  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2796  rubredoxin  36 
 
 		 53 aa  40.4  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.50585e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2061  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.36 
 
 		 462 aa  40  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1649  rubrerythrin  37.5 
 
 		 238 aa  40  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.429351 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>