118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3741 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3741  F0F1 ATP synthase subunit C  100 
 
 		 86 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2850  ATP synthase F0, C subunit  63.41 
 
 		 185 aa  94.7  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0959232 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  60.81 
 
 		 83 aa  93.2  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2849  F0F1 ATP synthase subunit C  67.44 
 
 		 86 aa  85.9  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0859343 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0952  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.146117  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  45.68 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0800  ATP synthase F0, C subunit  51.47 
 
 		 321 aa  65.1  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0333  ATP synthase F0, C subunit  45.45 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000631431  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  50.72 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  46.38 
 
 		 91 aa  64.3  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  44 
 
 		 91 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0016  ATP synthase F0, C subunit  47.14 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229893  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  44.44 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  42.86 
 
 		 91 aa  63.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000044416  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  42.86 
 
 		 91 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  44.44 
 
 		 82 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  52.54 
 
 		 81 aa  62  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  44.44 
 
 		 82 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3143  ATP synthase F0, C subunit  45.33 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00841289  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3360  ATP synthase F0, C subunit  47.83 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000392065  hitchhiker  0.00459127 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2192  F0F1 ATP synthase subunit C  50.82 
 
 		 82 aa  61.6  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  52.54 
 
 		 81 aa  61.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0484  F0F1 ATP synthase subunit C  50.85 
 
 		 81 aa  60.8  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  50.85 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  45.9 
 
 		 91 aa  60.1  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2623  F0F1 ATP synthase subunit C  47.46 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.989267 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  46.58 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3387  F0F1 ATP synthase subunit C  47.46 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000140393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  46.58 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  46.58 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  46.58 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2716  F0F1 ATP synthase subunit C  47.46 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2673  F0F1 ATP synthase subunit C  39.73 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3334  ATP synthase F0 subunit C  49.12 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1488  F0F1 ATP synthase subunit C  47.46 
 
 		 82 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300994  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3054  F0F1 ATP synthase subunit C  38.16 
 
 		 93 aa  57  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1959  F0F1 ATP synthase subunit C  40.28 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0440  F0F1 ATP synthase subunit C  36.59 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf042  ATP synthase C chain  37.68 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2067  ATP synthase F0, C subunit  46.55 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.107619 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0134  H+transporting two-sector ATPase C subunit  41.46 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.331941  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0631  ATP synthase F0, C subunit  48.21 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000562654  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0802  ATP synthase F0, C subunit  53.33 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0553  V-type ATP synthase subunit K  48.1 
 
 		 222 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.651546  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0363  V-type ATP synthase subunit K  48.1 
 
 		 222 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.100605  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0294  V-type ATP synthase subunit K  48.1 
 
 		 222 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.620174 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1619  V-type ATP synthase subunit K  48.1 
 
 		 222 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.573628  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0893  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit C  34.21 
 
 		 95 aa  53.5  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.154695 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0152  ATP synthase, C subunit  40 
 
 		 109 aa  53.5  0.0000009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2332  hypothetical protein  37.7 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0559  ATP synthase F0, C subunit  43.94 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0247806  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_498  ATP synthase F0, C subunit  43.94 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00034769  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1656  F0F1 ATP synthase subunit C  35.53 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1604  ATP synthase F0, C subunit  42.86 
 
 		 90 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2603  ATP synthase F0, C subunit  37.68 
 
 		 73 aa  52.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239607  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0533  ATP synthase F0, C subunit  43.94 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274514  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1166  F0F1 ATP synthase subunit C  34.92 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.214234  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0068  ATP synthase F0, C subunit  41.38 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2794  ATP synthase F0, C subunit  45.45 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.196475  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl110  ATP synthase subunit C  47.14 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1068  F0F1 ATP synthase subunit C  35.53 
 
 		 93 aa  51.2  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2086  ATP synthase F0, C subunit  43.86 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000184566  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3101  F0F1 ATP synthase subunit C  35 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00136484  normal  0.204805 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0947  F0F1 ATP synthase subunit C  34.43 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0801028  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0079  ATP synthase F0, subunit c  38.46 
 
 		 101 aa  50.4  0.000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0601  ATP synthase F0, C subunit  39.06 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3245  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  48.48 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4101  F0F1 ATP synthase subunit C  39.19 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000110269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0246  ATP synthase F0, C subunit  49.23 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.701859  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2700  ATP synthase F0, C subunit  34.43 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2994  F0F1 ATP synthase subunit C  39.24 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0061  V-type ATP synthase subunit K  49.25 
 
 		 223 aa  48.5  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1389  ATP synthase F0, C subunit  43.1 
 
 		 109 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19720  F0F1 ATP synthase subunit C  39.73 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00460397  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1281  F0F1 ATP synthase subunit C  40.28 
 
 		 100 aa  47.8  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  41.67 
 
 		 76 aa  47.4  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  42.19 
 
 		 74 aa  47.4  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0468  F0F1 ATP synthase subunit C  36.07 
 
 		 93 aa  47  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.160143 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1883  F0F1 ATP synthase subunit C  36.67 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.099934  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0045  F0F1 ATP synthase subunit C  37.7 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0943976 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2331  F0F1 ATP synthase subunit C  36.07 
 
 		 93 aa  46.2  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5555  F0F1 ATP synthase subunit C  36.07 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2255  ATP synthase F0, C subunit  39.66 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.139541  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0847  ATP synthase F0, C subunit  32.89 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0198  ATP synthase F0, C subunit  44.26 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000179911  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2777  F0F1 ATP synthase subunit C  36.99 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.787943  normal  0.376194 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0396  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  50 
 
 		 77 aa  44.3  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.6305  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0295  F0F1 ATP synthase subunit C  37.33 
 
 		 83 aa  44.7  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4623  ATP synthase F0, C subunit  41.18 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1201  ATP synthase F0 sector, C subunit  35.8 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.539498  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1213  ATP synthase F0, C subunit  41.07 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0957  F0F1 ATP synthase subunit C  38.89 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0330  F0F1 ATP synthase subunit C  43.42 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  35.71 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1892  H+transporting two-sector ATPase C subunit  40 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0141 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1014  F0F1 ATP synthase subunit C  34.62 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2701  ATP synthase F0, C subunit  42.31 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.025291  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1774  V-type ATP synthase subunit K  46.97 
 
 		 232 aa  42  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0943  F0F1 ATP synthase subunit C  34.62 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0878  F0F1 ATP synthase subunit C  34.62 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00312668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>