More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1660 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1660  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  100 
 
 
354 aa  738    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0130759  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3322  NADH-dependent flavine oxidoreductase  34.48 
 
 
325 aa  207  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.470336  normal  0.0119849 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0868  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  35.86 
 
 
335 aa  200  3e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.730901  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1392  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.94 
 
 
347 aa  191  2e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1968  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.71 
 
 
340 aa  187  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0146  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.15 
 
 
654 aa  186  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0968  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.43 
 
 
644 aa  186  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.132179  normal  0.162387 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1479  NADH:flavin oxidoreductase  33.14 
 
 
650 aa  186  6e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1551  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.27 
 
 
362 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0547796  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2716  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.01 
 
 
362 aa  184  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0870  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.42 
 
 
340 aa  182  7e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0011  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.2 
 
 
337 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0271468  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1107  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.95 
 
 
329 aa  182  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0771  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.74 
 
 
330 aa  181  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0157719 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2572  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.46 
 
 
652 aa  181  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000750697  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2489  xenobiotic reductase, putative  33.53 
 
 
366 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2429  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.43 
 
 
646 aa  180  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3913  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.58 
 
 
363 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1442  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.54 
 
 
357 aa  178  1e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00181939  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2220  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.08 
 
 
370 aa  179  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.708176  normal  0.437411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2296  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.08 
 
 
370 aa  179  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.559957  normal  0.67017 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0567  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.94 
 
 
360 aa  177  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0715  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  31.67 
 
 
365 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.489419 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1281  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.18 
 
 
363 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0765  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.43 
 
 
646 aa  175  8e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.564446  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1254  xenobiotic reductase A  30.88 
 
 
363 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3235  normal  0.321595 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4395  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.09 
 
 
365 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4137  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.88 
 
 
363 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2275  NADPH dehydrogenase NamA  34.04 
 
 
340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000882972  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3281  NADPH dehydrogenase NamA  34.07 
 
 
345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0293  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.77 
 
 
354 aa  174  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.818781  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2028  NADPH dehydrogenase NamA  33.75 
 
 
345 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2291  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.7 
 
 
368 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000084765  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0350  NADPH dehydrogenase NamA  33.94 
 
 
340 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1853  NADPH dehydrogenase NamA  34.38 
 
 
345 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2421  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.53 
 
 
668 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4014  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  33.04 
 
 
774 aa  172  7.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2429  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.21 
 
 
370 aa  172  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786429  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1891  NADPH dehydrogenase NamA  34.07 
 
 
345 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1743  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.6 
 
 
937 aa  171  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2038  NADPH dehydrogenase NamA  34.07 
 
 
345 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4322  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.68 
 
 
369 aa  171  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.700048  normal  0.249801 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2405  xenobiotic reductase A  31.58 
 
 
363 aa  170  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1455  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.7 
 
 
635 aa  170  4e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.691445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1843  NADPH dehydrogenase NamA  33.75 
 
 
345 aa  169  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2139  NADPH dehydrogenase NamA  33.54 
 
 
345 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4093  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.79 
 
 
369 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4273  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.79 
 
 
369 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2070  NADPH dehydrogenase NamA  33.86 
 
 
345 aa  169  7e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1736  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.09 
 
 
369 aa  169  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414914  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3244  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.09 
 
 
369 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324542  normal  0.664985 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4179  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.21 
 
 
369 aa  169  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.888395 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3701  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.21 
 
 
369 aa  169  8e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2106  NADPH dehydrogenase NamA  33.86 
 
 
345 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114267  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0827  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  33.72 
 
 
771 aa  168  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.13916  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2110  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.32 
 
 
725 aa  168  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.824421  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0619  NADPH dehydrogenase  34.26 
 
 
338 aa  167  2e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0699298  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7390  xenobiotic reductase A  33.24 
 
 
363 aa  167  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2190  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.1 
 
 
363 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0272574  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2652  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.61 
 
 
368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.357683  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1699  xenobiotic reductase A  30.12 
 
 
365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265579  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1814  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.9 
 
 
368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.284682  normal  0.0316292 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3342  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  30.71 
 
 
370 aa  166  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2486  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.26 
 
 
365 aa  166  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2530  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.61 
 
 
368 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.805138  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1888  NADPH dehydrogenase NamA  33.86 
 
 
345 aa  166  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0520303  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2537  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.61 
 
 
368 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.693892  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1529  NADPH dehydrogenase NamA  32.91 
 
 
346 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0702  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase protein  30.53 
 
 
370 aa  165  9e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00458318  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0472  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.5 
 
 
344 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1344  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.92 
 
 
676 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1578  2,4-dienoyl-CoA reductase  31.3 
 
 
684 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000245004  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3946  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.83 
 
 
361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.181914  normal  0.508638 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03180  NADH:flavin oxidoreductase  31.02 
 
 
687 aa  164  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.597765  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1244  NADH oxidase  32.41 
 
 
343 aa  164  3e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.516334  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0611  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.08 
 
 
370 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.316093 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0966  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.72 
 
 
369 aa  163  4.0000000000000004e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104436  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0369  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.12 
 
 
368 aa  162  6e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.014148  normal  0.044055 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0977  NADH/flavin oxidoreductase  32.45 
 
 
457 aa  162  6e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141758  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1724  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.9 
 
 
671 aa  162  7e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00189686  normal  0.0287247 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1649  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.35 
 
 
365 aa  162  9e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0652  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.82 
 
 
370 aa  162  9e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0749879 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1405  xenobiotic reductase A  29.2 
 
 
365 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1063  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  29.2 
 
 
365 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1489  xenobiotic reductase A  29.2 
 
 
365 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2296  NADH:flavin oxidoreductase  29.2 
 
 
365 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.879086  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0125  xenobiotic reductase A  29.2 
 
 
365 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0978  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  29.2 
 
 
365 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0523  xenobiotic reductase A  29.2 
 
 
365 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.483716  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0090  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.35 
 
 
370 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.552825 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4822  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.64 
 
 
669 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2353  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.51 
 
 
331 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0211  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  30.16 
 
 
370 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4082  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  29.89 
 
 
370 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4010  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  30.16 
 
 
370 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01164  2,4-dienoyl-CoA reductase  29.45 
 
 
680 aa  159  6e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35725  NADPH dehydrogenase (OYE31)  32.46 
 
 
422 aa  159  7e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0194  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.2 
 
 
711 aa  159  7e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0181  2,4-dienoyl-CoA reductase  28.93 
 
 
711 aa  159  8e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.126042 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0879  2,4-dienoyl-CoA reductase  28.86 
 
 
670 aa  159  8e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>