149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0688 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0688  sulfatase  100 
 
 
517 aa  1070    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3663  sulfatase  35.87 
 
 
512 aa  265  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1302  sulfatase  31.08 
 
 
527 aa  234  3e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.557571  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0885  sulfatase family protein  30.66 
 
 
527 aa  233  7.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0481411  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00782  predicted hydrolase, inner membrane  30.66 
 
 
527 aa  233  8.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2827  sulfatase  30.66 
 
 
527 aa  233  8.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.274935  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0872  sulfatase family protein  30.66 
 
 
527 aa  233  8.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0491523  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2533  sulfatase family protein  30.66 
 
 
527 aa  233  8.000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.768289  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00799  hypothetical protein  30.66 
 
 
527 aa  233  8.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2828  sulfatase  30.66 
 
 
527 aa  233  8.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0964  sulfatase family protein  30.66 
 
 
527 aa  232  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00476272  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0839  sulfatase family protein  30.66 
 
 
527 aa  232  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.195944  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0900  inner membrane protein YbiP  30.75 
 
 
526 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0872  inner membrane protein YbiP  30.75 
 
 
526 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0984  inner membrane protein YbiP  30.75 
 
 
526 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0963  hypothetical protein  30.75 
 
 
526 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0930  inner membrane protein YbiP  30.75 
 
 
526 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4754  sulfatase family protein  30.95 
 
 
499 aa  207  4e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0093  sulfatase  34.71 
 
 
550 aa  109  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3469  inner membrane protein yhbX  31.44 
 
 
505 aa  102  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0525732  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03039  predicted hydrolase, inner membrane  29.15 
 
 
541 aa  100  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0533  sulfatase  29.15 
 
 
547 aa  100  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3365  inner membrane protein yhbX  29.15 
 
 
541 aa  100  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00782202  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3658  inner membrane protein yhbX  29.15 
 
 
541 aa  100  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0592797  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4736  hypothetical protein  28.48 
 
 
515 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02990  hypothetical protein  29.15 
 
 
541 aa  100  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0526  sulfatase  29.15 
 
 
541 aa  100  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000512477 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4495  inner membrane protein yhbX  29.18 
 
 
505 aa  100  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0722596  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5415  hypothetical protein  22.81 
 
 
577 aa  96.7  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4031  sulfatase  22.81 
 
 
577 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4494  hypothetical protein  22.81 
 
 
577 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03840  conserved inner membrane protein  22.81 
 
 
577 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0113  hypothetical protein  22.2 
 
 
573 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03789  hypothetical protein  22.81 
 
 
577 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4441  hypothetical protein  22.81 
 
 
577 aa  95.1  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4189  hypothetical protein  22.81 
 
 
577 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4061  hypothetical protein  22.81 
 
 
577 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0774  putative membrane-associated, metal-dependent hydrolase  31.46 
 
 
560 aa  93.6  7e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000171309  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4402  hypothetical protein  22.59 
 
 
577 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.256321  normal  0.491316 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2584  hypothetical protein  23.32 
 
 
583 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04885  sulfatase domain protein  25.32 
 
 
552 aa  88.2  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.568838  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1154  sulfatase  22.08 
 
 
564 aa  87.4  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.614879  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04430  hypothetical protein  21.78 
 
 
589 aa  85.9  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.117859  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58610  hypothetical protein  20.88 
 
 
600 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2111  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  25.25 
 
 
571 aa  82  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2902  sulfatase  22.62 
 
 
553 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4359  hypothetical protein  22.25 
 
 
577 aa  80.1  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4446  hypothetical protein  22.25 
 
 
577 aa  80.1  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0100692 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4328  hypothetical protein  22.25 
 
 
577 aa  80.1  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.91856  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4449  hypothetical protein  22.25 
 
 
577 aa  80.1  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.155408 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4523  hypothetical protein  22.25 
 
 
577 aa  80.1  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000496918 
 
 
-
 
NC_002950  PG1039  integral membrane protein  26.94 
 
 
575 aa  80.1  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015393 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5131  hypothetical protein  21.23 
 
 
600 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214339  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1978  sulfatase  26.77 
 
 
545 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0756  hypothetical protein  20.9 
 
 
565 aa  77.8  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.112418 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1905  hypothetical protein  24.75 
 
 
553 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3137  hypothetical protein  21.18 
 
 
584 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3283  hypothetical protein  21.02 
 
 
592 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4610  sulfatase  26.49 
 
 
592 aa  70.5  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2532  sulfatase  24.01 
 
 
544 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.301618  normal  0.874005 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2579  hypothetical protein  22.18 
 
 
584 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4448  lipid A phosphoethanolamine transferase  23.6 
 
 
545 aa  66.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.62439  hitchhiker  0.00124758 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1777  sulfatase domain-containing protein  25.1 
 
 
589 aa  66.6  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2326  sulfatase  25.68 
 
 
547 aa  66.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.995391  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0341  phosphatidylethanolamine:Kdo2-lipid A phosphoethanolamine transferase  25.78 
 
 
532 aa  62.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1955  sulfatase  25.93 
 
 
589 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.822176  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2717  putative sulfatase  25.32 
 
 
555 aa  62.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.914458  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1756  sulfatase  25.93 
 
 
550 aa  62.8  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3282  sulfatase  23.85 
 
 
583 aa  62  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.100906  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3264  putative sulfatase  31.1 
 
 
556 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.225612  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5584  hypothetical protein  27.43 
 
 
549 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4248  lipid A phosphoethanolamine transferase  26.46 
 
 
508 aa  60.1  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.973235  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1724  hypothetical protein  25.07 
 
 
552 aa  60.1  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0657943  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1916  sulfatase  24.04 
 
 
545 aa  60.1  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.725859  normal  0.322218 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1562  sulfatase  26.72 
 
 
558 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0048353  hitchhiker  0.00604368 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3156  hypothetical protein  23.67 
 
 
552 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84731  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0236  sulfatase  24.03 
 
 
535 aa  58.9  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00378  putative sulfatase  25.78 
 
 
300 aa  58.9  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1758  hypothetical protein  24.79 
 
 
538 aa  59.3  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.534399  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3923  hypothetical protein  22.61 
 
 
547 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107021  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2097  sulfatase  24.15 
 
 
541 aa  58.5  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1387  phosphatidylethanolamine:Kdo2-lipid A phosphoethanolamine transferase  26.47 
 
 
549 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1018  sulfatase  24.79 
 
 
544 aa  57.8  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.663871  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04472  inner membrane protein  21.71 
 
 
532 aa  57.8  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.898006  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21210  hypothetical protein  27.04 
 
 
551 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1810  hypothetical protein  25.54 
 
 
551 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39020  hypothetical protein  25.85 
 
 
567 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0446171  normal  0.409491 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1454  sulfatase  20.68 
 
 
542 aa  57.4  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1318  integral membrane protein  23.45 
 
 
539 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2985  sulfatase  27.9 
 
 
544 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00955472  normal  0.0251459 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2193  sulfatase  24.47 
 
 
542 aa  55.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444618  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3323  hypothetical protein  24.75 
 
 
572 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364714  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4592  hypothetical protein  25.55 
 
 
545 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0471  phosphatidylethanolamine:Kdo2-lipid A phosphoethanolamine transferase  23.11 
 
 
555 aa  55.5  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.882488 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2091  protein of unknown function DUF1705  24.15 
 
 
541 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0178711  normal  0.189898 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2500  hypothetical protein  24.14 
 
 
573 aa  55.1  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.549124 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2103  hypothetical protein  24.15 
 
 
541 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1048  sulfatase  23.36 
 
 
580 aa  55.1  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2371  hypothetical protein  24.15 
 
 
541 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00897064  normal  0.689534 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1711  sulfatase  24.39 
 
 
551 aa  54.7  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155197  normal  0.648833 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>