31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1059 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1059  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  531  1e-150  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.269022  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0487  hypothetical protein  58.17 
 
 
263 aa  305  5.0000000000000004e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.38522  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2004  hypothetical protein  53.38 
 
 
266 aa  290  1e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00153621  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0352  hypothetical protein  55.16 
 
 
248 aa  281  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0325  hypothetical protein  54.75 
 
 
259 aa  280  2e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.391296  normal  0.511611 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1280  hypothetical protein  38.62 
 
 
247 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106415  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3994  hypothetical protein  38.87 
 
 
247 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.900475  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4458  hypothetical protein  38.06 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1242  hypothetical protein  37.07 
 
 
286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0303154  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1788  hypothetical protein  38.35 
 
 
264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000868196  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1782  hypothetical protein  38.35 
 
 
264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2582  hypothetical protein  36.84 
 
 
247 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1340  hypothetical protein  36.84 
 
 
247 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1422  hypothetical protein  36.84 
 
 
247 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.727382  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0224  hypothetical protein  36.84 
 
 
247 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0496  hypothetical protein  36.84 
 
 
247 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.172115  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1251  hypothetical protein  36.84 
 
 
247 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4078  hypothetical protein  36.89 
 
 
246 aa  155  9e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.682161  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0790  hypothetical protein  36.84 
 
 
269 aa  150  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000900967  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1419  hypothetical protein  34.01 
 
 
302 aa  142  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.136441  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1622  hypothetical protein  27.95 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0903  hypothetical protein  26.82 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.366145  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02098  hypothetical protein  26.19 
 
 
367 aa  57.4  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3588  hypothetical protein  25.67 
 
 
259 aa  56.6  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0475559 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1740  hypothetical protein  24.18 
 
 
282 aa  48.9  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156192 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1323  hypothetical protein  24.41 
 
 
253 aa  47  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2939  hypothetical protein  36.84 
 
 
290 aa  46.2  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0541  hypothetical protein  27.72 
 
 
265 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.589346  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0573  hypothetical protein  22.22 
 
 
266 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.248781  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0829  hypothetical protein  29.49 
 
 
261 aa  43.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3650  hypothetical protein  27.91 
 
 
323 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>