13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1740 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1740  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  587  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156192 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1101  hypothetical protein  34.94 
 
 
309 aa  133  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1682  hypothetical protein  34.8 
 
 
305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.450349 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3650  hypothetical protein  34.6 
 
 
323 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02098  hypothetical protein  28.22 
 
 
367 aa  100  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1323  hypothetical protein  29.44 
 
 
253 aa  97.1  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0059  hypothetical protein  24.6 
 
 
265 aa  81.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110579  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3588  hypothetical protein  30.41 
 
 
259 aa  68.9  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0475559 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0940  hypothetical protein  24 
 
 
291 aa  52.4  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0325  hypothetical protein  26.02 
 
 
259 aa  48.9  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.391296  normal  0.511611 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1059  hypothetical protein  24.18 
 
 
263 aa  48.9  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.269022  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02030  hypothetical protein  25.11 
 
 
293 aa  47.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00038  hypothetical protein  22.45 
 
 
249 aa  47  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.960532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>