16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1323 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1323  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02098  hypothetical protein  32.56 
 
 		 367 aa  102  7e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1740  hypothetical protein  29.44 
 
 		 282 aa  97.1  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156192 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3650  hypothetical protein  30.28 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1101  hypothetical protein  27.34 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3588  hypothetical protein  26.92 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475559 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1682  hypothetical protein  31.58 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.450349 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02030  hypothetical protein  28 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00038  hypothetical protein  25 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.960532  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0059  hypothetical protein  25.4 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1242  hypothetical protein  24.64 
 
 		 286 aa  48.9  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0303154  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1059  hypothetical protein  24.41 
 
 		 263 aa  47  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.269022  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1782  hypothetical protein  25.91 
 
 		 264 aa  45.8  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1788  hypothetical protein  25.91 
 
 		 264 aa  45.8  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000868196  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2004  hypothetical protein  25.9 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00153621  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4443  hypothetical protein  23.97 
 
 		 250 aa  42.4  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0884605  normal  0.12904 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>