26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1242 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1242  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0303154  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1788  hypothetical protein  62.89 
 
 
264 aa  323  3e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000868196  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1782  hypothetical protein  62.89 
 
 
264 aa  323  3e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0790  hypothetical protein  61.22 
 
 
269 aa  304  9.000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000900967  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1059  hypothetical protein  37.07 
 
 
263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.269022  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2004  hypothetical protein  35.8 
 
 
266 aa  163  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00153621  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0352  hypothetical protein  38.82 
 
 
248 aa  155  9e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0487  hypothetical protein  37.11 
 
 
263 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.38522  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0325  hypothetical protein  37.35 
 
 
259 aa  144  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.391296  normal  0.511611 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1280  hypothetical protein  29.27 
 
 
247 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106415  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4458  hypothetical protein  28.05 
 
 
247 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1419  hypothetical protein  27.94 
 
 
302 aa  90.5  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.136441  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3994  hypothetical protein  28.05 
 
 
247 aa  89.4  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.900475  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2582  hypothetical protein  26.61 
 
 
247 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1340  hypothetical protein  26.61 
 
 
247 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1422  hypothetical protein  26.61 
 
 
247 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.727382  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0496  hypothetical protein  26.61 
 
 
247 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.172115  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0224  hypothetical protein  26.61 
 
 
247 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1251  hypothetical protein  26.61 
 
 
247 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4078  hypothetical protein  26.83 
 
 
246 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.682161  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1622  hypothetical protein  28.73 
 
 
287 aa  72.8  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0903  hypothetical protein  27.49 
 
 
237 aa  52.4  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.366145  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1323  hypothetical protein  24.64 
 
 
253 aa  48.9  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3496  hypothetical protein  30.51 
 
 
277 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2074  hypothetical protein  34.65 
 
 
277 aa  42.7  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000228759 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3650  hypothetical protein  25 
 
 
323 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>