21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0903 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0903  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  473  1e-132  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.366145  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2004  hypothetical protein  28.03 
 
 
266 aa  82.4  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00153621  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1280  hypothetical protein  28.63 
 
 
247 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106415  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1059  hypothetical protein  26.04 
 
 
263 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.269022  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4458  hypothetical protein  27.04 
 
 
247 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3994  hypothetical protein  26.61 
 
 
247 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.900475  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1419  hypothetical protein  24.11 
 
 
302 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.136441  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0325  hypothetical protein  29.01 
 
 
259 aa  63.9  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.391296  normal  0.511611 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4078  hypothetical protein  25.45 
 
 
246 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.682161  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0487  hypothetical protein  24.91 
 
 
263 aa  61.6  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.38522  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1422  hypothetical protein  23.32 
 
 
247 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.727382  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1340  hypothetical protein  23.32 
 
 
247 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1251  hypothetical protein  23.32 
 
 
247 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0496  hypothetical protein  23.32 
 
 
247 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.172115  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0224  hypothetical protein  23.32 
 
 
247 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2582  hypothetical protein  23.32 
 
 
247 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0790  hypothetical protein  22.69 
 
 
269 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000900967  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0352  hypothetical protein  27.92 
 
 
248 aa  58.5  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1242  hypothetical protein  27.49 
 
 
286 aa  52.4  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0303154  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1782  hypothetical protein  28.77 
 
 
264 aa  48.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1788  hypothetical protein  28.77 
 
 
264 aa  48.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000868196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>