26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0352 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0352  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  495  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0325  hypothetical protein  81.45 
 
 
259 aa  416  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.391296  normal  0.511611 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2004  hypothetical protein  54.37 
 
 
266 aa  283  1.0000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00153621  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1059  hypothetical protein  55.16 
 
 
263 aa  281  9e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.269022  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0487  hypothetical protein  56.35 
 
 
263 aa  280  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.38522  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1242  hypothetical protein  38.82 
 
 
286 aa  155  7e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0303154  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1788  hypothetical protein  36.69 
 
 
264 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000868196  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1782  hypothetical protein  36.69 
 
 
264 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2582  hypothetical protein  37.8 
 
 
247 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1340  hypothetical protein  37.8 
 
 
247 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1422  hypothetical protein  37.8 
 
 
247 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.727382  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0496  hypothetical protein  37.8 
 
 
247 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.172115  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0224  hypothetical protein  37.8 
 
 
247 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1251  hypothetical protein  37.8 
 
 
247 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1280  hypothetical protein  36.33 
 
 
247 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106415  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3994  hypothetical protein  36.95 
 
 
247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.900475  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1419  hypothetical protein  36.59 
 
 
302 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.136441  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4458  hypothetical protein  36.55 
 
 
247 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4078  hypothetical protein  36.03 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.682161  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0790  hypothetical protein  35.6 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000900967  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1622  hypothetical protein  25.09 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3588  hypothetical protein  32.35 
 
 
259 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0475559 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1101  hypothetical protein  25.65 
 
 
309 aa  53.5  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0903  hypothetical protein  27.68 
 
 
237 aa  52  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.366145  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02098  hypothetical protein  27.41 
 
 
367 aa  51.2  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1682  hypothetical protein  25.31 
 
 
305 aa  43.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.450349 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>