27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1788 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1788  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  537  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000868196  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1782  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  537  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1242  hypothetical protein  62.89 
 
 
286 aa  323  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0303154  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0790  hypothetical protein  57.25 
 
 
269 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000900967  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2004  hypothetical protein  36.19 
 
 
266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00153621  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1059  hypothetical protein  38.35 
 
 
263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.269022  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0352  hypothetical protein  36.69 
 
 
248 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0325  hypothetical protein  33.97 
 
 
259 aa  145  6e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.391296  normal  0.511611 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0487  hypothetical protein  34.48 
 
 
263 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.38522  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4458  hypothetical protein  30.2 
 
 
247 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3994  hypothetical protein  29.8 
 
 
247 aa  92.4  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.900475  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1419  hypothetical protein  29.63 
 
 
302 aa  91.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.136441  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4078  hypothetical protein  29.63 
 
 
246 aa  86.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.682161  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1280  hypothetical protein  27.76 
 
 
247 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106415  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2582  hypothetical protein  27.35 
 
 
247 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1340  hypothetical protein  27.35 
 
 
247 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1422  hypothetical protein  27.35 
 
 
247 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.727382  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0496  hypothetical protein  27.35 
 
 
247 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.172115  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0224  hypothetical protein  27.35 
 
 
247 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1251  hypothetical protein  27.35 
 
 
247 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1622  hypothetical protein  26.98 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3496  hypothetical protein  30.83 
 
 
277 aa  49.3  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0903  hypothetical protein  28.77 
 
 
237 aa  48.9  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.366145  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  28.91 
 
 
1793 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1323  hypothetical protein  25.91 
 
 
253 aa  45.8  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  27.78 
 
 
623 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3650  hypothetical protein  27.78 
 
 
323 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>