25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4458 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4458  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  507  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3994  hypothetical protein  97.98 
 
 
247 aa  471  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.900475  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1280  hypothetical protein  86.64 
 
 
247 aa  420  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106415  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4078  hypothetical protein  75.3 
 
 
246 aa  360  8e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.682161  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2582  hypothetical protein  68.02 
 
 
247 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1340  hypothetical protein  68.02 
 
 
247 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1422  hypothetical protein  68.02 
 
 
247 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.727382  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0496  hypothetical protein  68.02 
 
 
247 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.172115  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0224  hypothetical protein  68.02 
 
 
247 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1251  hypothetical protein  68.02 
 
 
247 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1419  hypothetical protein  68.42 
 
 
302 aa  334  5.999999999999999e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.136441  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1059  hypothetical protein  37.97 
 
 
263 aa  172  5e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.269022  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2004  hypothetical protein  35.47 
 
 
266 aa  137  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00153621  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0487  hypothetical protein  37.35 
 
 
263 aa  131  9e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.38522  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0352  hypothetical protein  36.55 
 
 
248 aa  128  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0325  hypothetical protein  33.46 
 
 
259 aa  122  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.391296  normal  0.511611 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1782  hypothetical protein  29.96 
 
 
264 aa  98.6  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1788  hypothetical protein  29.96 
 
 
264 aa  98.6  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000868196  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1242  hypothetical protein  28.4 
 
 
286 aa  93.6  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0303154  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0790  hypothetical protein  26.21 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000900967  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0903  hypothetical protein  27.94 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.366145  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0573  hypothetical protein  26.54 
 
 
266 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.248781  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02098  hypothetical protein  25.62 
 
 
367 aa  52.4  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0541  hypothetical protein  25.23 
 
 
265 aa  52.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.589346  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1622  hypothetical protein  23.98 
 
 
287 aa  43.5  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>