25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3994 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3994  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  507  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.900475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4458  hypothetical protein  97.98 
 
 		 247 aa  471  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1280  hypothetical protein  87.85 
 
 		 247 aa  424  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4078  hypothetical protein  74.9 
 
 		 246 aa  359  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.682161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2582  hypothetical protein  68.83 
 
 		 247 aa  337  8e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1340  hypothetical protein  68.83 
 
 		 247 aa  337  8e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1422  hypothetical protein  68.83 
 
 		 247 aa  337  8e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.727382  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0496  hypothetical protein  68.83 
 
 		 247 aa  337  8e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.172115  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0224  hypothetical protein  68.83 
 
 		 247 aa  337  8e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1251  hypothetical protein  68.83 
 
 		 247 aa  337  8e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1419  hypothetical protein  68.42 
 
 		 302 aa  333  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.136441  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1059  hypothetical protein  38.72 
 
 		 263 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.269022  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2004  hypothetical protein  35.47 
 
 		 266 aa  137  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00153621  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0487  hypothetical protein  36.96 
 
 		 263 aa  132  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.38522  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0352  hypothetical protein  36.95 
 
 		 248 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0325  hypothetical protein  34.33 
 
 		 259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.391296  normal  0.511611 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1782  hypothetical protein  29.57 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1788  hypothetical protein  29.57 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000868196  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1242  hypothetical protein  28.4 
 
 		 286 aa  90.5  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0303154  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0790  hypothetical protein  25.1 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000900967  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0903  hypothetical protein  27.69 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.366145  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0573  hypothetical protein  26.54 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.248781  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02098  hypothetical protein  27.16 
 
 		 367 aa  53.1  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0541  hypothetical protein  25.23 
 
 		 265 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.589346  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1622  hypothetical protein  24.8 
 
 		 287 aa  45.8  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>