24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2939 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2939  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0467  hypothetical protein  38.08 
 
 
293 aa  169  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151068  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3413  hypothetical protein  36.25 
 
 
285 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120615  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2020  hypothetical protein  31.68 
 
 
293 aa  136  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00123308  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2064  hypothetical protein  31.85 
 
 
296 aa  132  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000220233 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2158  hypothetical protein  30.53 
 
 
296 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0203  hypothetical protein  24.8 
 
 
270 aa  57.4  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4220  hypothetical protein  25.91 
 
 
249 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.596689 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1755  hypothetical protein  26.59 
 
 
230 aa  53.9  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.071754  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1691  hypothetical protein  32.93 
 
 
281 aa  52.8  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1227  hypothetical protein  26.21 
 
 
249 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0996282  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1196  hypothetical protein  26.21 
 
 
251 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0620  hypothetical protein  28.83 
 
 
261 aa  50.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.228252  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0772  hypothetical protein  28.83 
 
 
261 aa  50.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0829  hypothetical protein  22.83 
 
 
261 aa  47  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1059  hypothetical protein  36.84 
 
 
263 aa  45.8  0.0009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.269022  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1422  hypothetical protein  32.53 
 
 
247 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.727382  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1251  hypothetical protein  32.53 
 
 
247 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2582  hypothetical protein  32.53 
 
 
247 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0224  hypothetical protein  32.53 
 
 
247 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1340  hypothetical protein  32.53 
 
 
247 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0496  hypothetical protein  32.53 
 
 
247 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.172115  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2767  hypothetical protein  30 
 
 
426 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1419  hypothetical protein  28.44 
 
 
302 aa  42.7  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.136441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>