52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2744 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2744  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  543  1e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2029  hypothetical protein  38.6 
 
 		 286 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.115384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0876  hypothetical protein  37.44 
 
 		 248 aa  132  5e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162411  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0984  hypothetical protein  36.97 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000638304  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0367  copper amine oxidase domain protein  42.31 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0024896 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0892  Rhodanese domain protein  29.05 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0596702  hitchhiker  0.0000457584 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0618  cell wall hydrolase/autolysin  38.46 
 
 		 451 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000253724  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0958  copper amine oxidase domain protein  53.66 
 
 		 423 aa  52.8  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.990668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1536  copper amine oxidase domain protein  40 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000116317 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2183  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.71 
 
 		 431 aa  50.4  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000115725 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0361  copper amine oxidase domain protein  38.89 
 
 		 549 aa  50.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.977127  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1258  copper amine oxidase-like protein  32.89 
 
 		 259 aa  49.3  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  36.76 
 
 		 450 aa  48.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  36.49 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4154  copper amine oxidase domain protein  40 
 
 		 781 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000308518  hitchhiker  0.000000100908 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0706  copper amine oxidase domain-containing protein  26.02 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0402  copper amine oxidase-like protein  35.38 
 
 		 732 aa  47  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000691297  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1020  copper amine oxidase domain protein  39.62 
 
 		 481 aa  47  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.514045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  35.94 
 
 		 1305 aa  47.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1077  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.15 
 
 		 657 aa  47.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0200962 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1215  copper amine oxidase domain-containing protein  51.43 
 
 		 784 aa  47  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000445409  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0824  copper amine oxidase-like protein  44 
 
 		 591 aa  47  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195798  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4080  copper amine oxidase domain protein  50 
 
 		 501 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3230  copper amine oxidase domain protein  35.29 
 
 		 299 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.41019  normal  0.147437 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  34.33 
 
 		 452 aa  46.2  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0130  copper amine oxidase domain protein  46.15 
 
 		 414 aa  45.8  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0133  hypothetical protein  42.22 
 
 		 741 aa  45.8  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000162443  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0754  copper amine oxidase domain protein  50 
 
 		 589 aa  45.4  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0048  copper amine oxidase-like protein  38.81 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0047  copper amine oxidase-like protein  38.81 
 
 		 269 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  46.51 
 
 		 483 aa  44.7  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1004  copper amine oxidase-like  46.67 
 
 		 421 aa  44.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0001699 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2153  copper amine oxidase domain protein  40 
 
 		 1118 aa  44.3  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0231006  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0044  copper amine oxidase domain protein  41.51 
 
 		 754 aa  44.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00564883  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0524  copper amine oxidase domain protein  41.43 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1643  copper amine oxidase domain protein  48.57 
 
 		 763 aa  44.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00153148  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2678  copper amine oxidase domain-containing protein  43.18 
 
 		 474 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4153  copper amine oxidase domain protein  42.86 
 
 		 366 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  hitchhiker  0.0000000469459 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1778  copper amine oxidase-like protein  30.61 
 
 		 319 aa  43.5  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103341  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0185  cell wall hydrolase/autolysin  29.59 
 
 		 948 aa  43.5  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00443483  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1514  copper amine oxidase domain-containing protein  35 
 
 		 281 aa  43.1  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0593  copper amine oxidase-like protein  33.82 
 
 		 332 aa  43.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.38 
 
 		 907 aa  43.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  35.94 
 
 		 478 aa  42.7  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  38 
 
 		 456 aa  42.7  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3188  copper amine oxidase-like protein  32.81 
 
 		 495 aa  42.4  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000368192  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2109  copper amine oxidase-like protein  40.68 
 
 		 845 aa  42.7  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0587  copper amine oxidase domain protein  40.43 
 
 		 263 aa  42.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00651407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0139  hypothetical protein  44.19 
 
 		 758 aa  42.4  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0523  copper amine oxidase-like  46.34 
 
 		 298 aa  42.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000809861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2654  hypothetical protein  33.73 
 
 		 234 aa  42.4  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1827  copper amine oxidase-like protein  37.5 
 
 		 323 aa  42.4  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.19527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>