61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0865 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0865  acyl carrier protein  100 
 
 
129 aa  258  3e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3122  phosphopantetheine-binding protein  37.01 
 
 
128 aa  67.8  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.172953  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0400  hypothetical protein  47.22 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0424  hypothetical protein  35 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0230  acyl carrier protein  45.1 
 
 
79 aa  48.9  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1011  acyl carrier protein  40.38 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303772  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  38.46 
 
 
75 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  34.55 
 
 
80 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  40.35 
 
 
81 aa  45.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  40.35 
 
 
81 aa  45.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0944  acyl carrier protein  43.86 
 
 
79 aa  45.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000174331  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2117  acyl carrier protein  48 
 
 
92 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.307838  hitchhiker  0.00250783 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  42.86 
 
 
74 aa  45.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1320  acyl carrier protein  48 
 
 
94 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0493  acyl carrier protein  46 
 
 
77 aa  44.3  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  42.31 
 
 
75 aa  44.3  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2359  acyl carrier protein  48 
 
 
105 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.701799  normal  0.0109662 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2371  acyl carrier protein  48 
 
 
93 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.131392  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3647  acyl carrier protein  42 
 
 
84 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742845  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0468  acyl carrier protein  44 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2029  acyl carrier protein  46 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0561  acyl carrier protein  44.23 
 
 
77 aa  42.7  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  35.29 
 
 
74 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3522  acyl carrier protein  44 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1263  acyl carrier protein  44 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1496  acyl carrier protein  44 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5351  acyl carrier protein  34 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0855  acyl carrier protein  46 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1345  acyl carrier protein  38.46 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.095592  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1026  acyl carrier protein  43.14 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000177026  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0847  acyl carrier protein  46 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0285  acyl carrier protein  39.22 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3353  acyl carrier protein  42 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.53669  normal  0.0790473 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2111  acyl carrier protein  42 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144779  normal  0.165327 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2090  acyl carrier protein  42 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  39.22 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0310  acyl carrier protein  44.9 
 
 
76 aa  42  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00336649  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2689  acyl carrier protein  37.04 
 
 
82 aa  41.6  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  42 
 
 
78 aa  41.6  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1246  acyl carrier protein  42 
 
 
93 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.15129  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1741  acyl carrier protein  46 
 
 
95 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463216  normal  0.237762 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1506  acyl carrier protein  42 
 
 
93 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41568  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  40.82 
 
 
78 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1398  acyl carrier protein  36.54 
 
 
78 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3716  phosphopantetheine-binding  23.14 
 
 
124 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197892  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1610  Acyl carrier protein (ACP)  39.22 
 
 
90 aa  41.2  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  42.86 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0883  acyl carrier protein  45.1 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000242851  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  40.82 
 
 
78 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1291  acyl carrier protein  42.86 
 
 
77 aa  40.8  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0464  acyl carrier protein  40.82 
 
 
78 aa  40.4  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1316  acyl carrier protein  42.86 
 
 
77 aa  40.8  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17331  acyl carrier protein (ACP)  48 
 
 
80 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0459  acyl carrier protein  40.82 
 
 
78 aa  40.4  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997029  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0572  acyl carrier protein  40.82 
 
 
78 aa  40.4  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000726263  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2233  acyl carrier protein  40 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2427  acyl carrier protein  40.82 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2262  acyl carrier protein  40.82 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.033873  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1053  acyl carrier protein  40.82 
 
 
79 aa  40.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.549233 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0975  acyl carrier protein  37.74 
 
 
80 aa  40  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.553759  normal  0.616153 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0408  acyl carrier protein  42.86 
 
 
79 aa  40  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.442287  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>