More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5398 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010333  Caul_5398  hypothetical protein  100 
 
 
538 aa  1031    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.61189  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5113  ABC-1 domain protein  39.71 
 
 
544 aa  333  3e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3020  hypothetical protein  38.68 
 
 
544 aa  327  3e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1807  hypothetical protein  41.2 
 
 
560 aa  327  3e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  40.13 
 
 
561 aa  317  4e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  41.51 
 
 
558 aa  317  5e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  40.34 
 
 
559 aa  316  6e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5555  2-octaprenylphenol hydroxylase  38.72 
 
 
584 aa  315  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1333  ABC-1 domain protein  39.87 
 
 
543 aa  312  1e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2071  ABC-1 domain protein  37.31 
 
 
581 aa  311  1e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0987216  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0769  ABC-1 domain protein  39.78 
 
 
543 aa  310  4e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.477502 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1021  hypothetical protein  39.78 
 
 
556 aa  310  4e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.396117  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  39.61 
 
 
568 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0324  ABC-1 domain protein  37.5 
 
 
581 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3415  hypothetical protein  41.23 
 
 
560 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362763 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2519  hypothetical protein  37.63 
 
 
582 aa  301  3e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4176  hypothetical protein  38.67 
 
 
582 aa  301  3e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.118279  normal  0.965064 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0994  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.45 
 
 
559 aa  296  8e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.380493  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2885  ABC-1 domain protein  37.18 
 
 
582 aa  294  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0017  2-octaprenylphenol hydroxylase  40.17 
 
 
592 aa  284  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1598  hypothetical protein  36.42 
 
 
591 aa  278  2e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429743  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0390  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.71 
 
 
559 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5397  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.92 
 
 
501 aa  272  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.567178  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1129  hypothetical protein  37.94 
 
 
586 aa  266  8e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.755278  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2799  hypothetical protein  35.59 
 
 
546 aa  266  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0199828 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  32.32 
 
 
561 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000298772  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  33.12 
 
 
563 aa  252  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  33.7 
 
 
565 aa  251  3e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000186884  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.67 
 
 
559 aa  250  5e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.33 
 
 
559 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1973  ABC-1 domain protein  32.26 
 
 
547 aa  239  9e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.921372  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  31.24 
 
 
560 aa  239  9e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  30.17 
 
 
558 aa  238  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  33.74 
 
 
557 aa  238  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  29.3 
 
 
558 aa  236  7e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  33.19 
 
 
561 aa  233  8.000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.75 
 
 
561 aa  231  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  30.71 
 
 
565 aa  230  5e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  30.71 
 
 
565 aa  230  5e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1005  hypothetical protein  28.19 
 
 
564 aa  228  1e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0249187 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  30.59 
 
 
560 aa  228  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  29.68 
 
 
558 aa  228  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  28.36 
 
 
555 aa  226  7e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  30.26 
 
 
557 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2950  ABC-1 domain protein  29.61 
 
 
549 aa  221  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4764  2-octaprenylphenol hydroxylase  38.57 
 
 
501 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.102687 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  29.2 
 
 
558 aa  220  6e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  31.09 
 
 
562 aa  219  7.999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3335  ABC-1 domain protein  29.76 
 
 
549 aa  219  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0521538  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.12 
 
 
554 aa  218  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.41 
 
 
559 aa  218  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2767  ABC-1 domain protein  29.55 
 
 
549 aa  217  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  31.24 
 
 
558 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  30.32 
 
 
563 aa  216  7e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  32.38 
 
 
552 aa  216  9.999999999999999e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  26.1 
 
 
558 aa  214  3.9999999999999995e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  31.05 
 
 
551 aa  213  4.9999999999999996e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  30.4 
 
 
556 aa  214  4.9999999999999996e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2681  hypothetical protein  30.17 
 
 
547 aa  212  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.259023 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0841  ABC-1 domain-containing protein  36.89 
 
 
652 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0918  serine/threonine protein kinase  28.51 
 
 
526 aa  212  2e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.51 
 
 
573 aa  211  4e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  35.9 
 
 
544 aa  210  6e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.16 
 
 
553 aa  209  1e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  32.5 
 
 
550 aa  209  1e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  31 
 
 
599 aa  208  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  34.2 
 
 
557 aa  208  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  33.77 
 
 
556 aa  208  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1760  ABC-1 domain-containing protein  29.79 
 
 
547 aa  207  4e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.85 
 
 
549 aa  207  5e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1941  ABC-1 domain protein  29.28 
 
 
549 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  31.91 
 
 
552 aa  206  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  31.34 
 
 
582 aa  205  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000924249  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0856  hypothetical protein  30.18 
 
 
555 aa  204  5e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0243  hypothetical protein  30.68 
 
 
565 aa  202  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.469557  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2998  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33.76 
 
 
543 aa  201  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.46 
 
 
530 aa  200  6e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  31.14 
 
 
585 aa  199  9e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  31.38 
 
 
542 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5644  ABC-1 domain protein  35.48 
 
 
646 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0588147  normal  0.172303 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2702  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.81 
 
 
534 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136263 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0176  2-octaprenylphenol hydroxylase  27.87 
 
 
547 aa  197  3e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.05 
 
 
509 aa  197  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  29.96 
 
 
561 aa  197  4.0000000000000005e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  28.66 
 
 
537 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2537  hypothetical protein  28.06 
 
 
537 aa  194  4e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0222  ABC-1 domain protein  28.49 
 
 
571 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.164391  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1499  hypothetical protein  31.69 
 
 
540 aa  192  9e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2415  hypothetical protein  31.72 
 
 
545 aa  192  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0766121  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  29.27 
 
 
578 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00564  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33.67 
 
 
544 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0175  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.98 
 
 
551 aa  191  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356136  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001925  ubiquinone biosynthesis monooxygenase UbiB  33.67 
 
 
544 aa  191  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4049  hypothetical protein  28.69 
 
 
556 aa  190  5.999999999999999e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.240057  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  30.94 
 
 
559 aa  189  9e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3756  ABC-1 domain protein  31.71 
 
 
563 aa  189  9e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.67 
 
 
547 aa  189  9e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2345  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.1 
 
 
557 aa  189  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.391466  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1047  protein kinase  32.88 
 
 
525 aa  188  2e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1338  ABC-1 domain protein  29.31 
 
 
562 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328718 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>