More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4435 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4435  50S ribosomal protein L11  100 
 
 		 143 aa  289  9e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0833  50S ribosomal protein L11  71.83 
 
 		 143 aa  217  3.9999999999999997e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.714386  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2563  50S ribosomal protein L11  69.72 
 
 		 143 aa  209  9e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1823  50S ribosomal protein L11  65.25 
 
 		 142 aa  207  4e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.135034  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1442  50S ribosomal protein L11  69.01 
 
 		 143 aa  204  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.337085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3472  50S ribosomal protein L11  64.29 
 
 		 142 aa  199  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.275844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1343  50S ribosomal protein L11  64.08 
 
 		 142 aa  199  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0774434  normal  0.0441915 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1943  50S ribosomal protein L11  64.54 
 
 		 142 aa  199  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0464106  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1527  50S ribosomal protein L11  62.68 
 
 		 142 aa  199  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1248  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 		 142 aa  197  3e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.208102  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2277  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 142 aa  197  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1209  50S ribosomal protein L11  63.12 
 
 		 142 aa  197  5e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1346  50S ribosomal protein L11  62.68 
 
 		 142 aa  197  5e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5087  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 142 aa  196  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0150529  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2725  50S ribosomal protein L11  64.79 
 
 		 142 aa  196  7e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.053271  normal  0.344751 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3692  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 142 aa  196  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1062  ribosomal protein L11  69.01 
 
 		 143 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0402568  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3201  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 142 aa  195  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0229  50S ribosomal protein L11  65 
 
 		 141 aa  194  4.0000000000000005e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0737159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0260  50S ribosomal protein L11  64.29 
 
 		 141 aa  193  8.000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0563  50S ribosomal protein L11  62.84 
 
 		 150 aa  191  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3864  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 142 aa  190  5e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.094811 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3360  50S ribosomal protein L11  63.95 
 
 		 149 aa  190  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.711541  normal  0.0993173 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0284  ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 142 aa  190  7e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000710656  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1806  50S ribosomal protein L11  62.68 
 
 		 142 aa  190  7e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.785581  normal  0.199785 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4479  50S ribosomal protein L11  62.84 
 
 		 149 aa  189  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.116723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3998  50S ribosomal protein L11  62.84 
 
 		 149 aa  189  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.748509  normal  0.915544 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0567  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 		 142 aa  189  1e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000313352  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4367  50S ribosomal protein L11  62.84 
 
 		 149 aa  189  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1956  50S ribosomal protein L11  58.74 
 
 		 144 aa  188  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0974  50S ribosomal protein L11  60.71 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0169903 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3844  50S ribosomal protein L11  62.16 
 
 		 149 aa  187  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.638614 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2956  50S ribosomal protein L11  58.74 
 
 		 144 aa  186  9e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0664749 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2335  50S ribosomal protein L11  64.03 
 
 		 143 aa  186  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00025621  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1418  50S ribosomal protein L11  61.97 
 
 		 143 aa  186  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.816838  normal  0.409457 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1320  50S ribosomal protein L11  61.97 
 
 		 143 aa  186  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.458077  normal  0.354215 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2335  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 143 aa  186  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345629  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1819  50S ribosomal protein L11  61.97 
 
 		 143 aa  186  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.674274  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2699  50S ribosomal protein L11  59.86 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0743  50S ribosomal protein L11  60.14 
 
 		 150 aa  185  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0168765 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2806  50S ribosomal protein L11  60.71 
 
 		 142 aa  184  5e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221343  normal  0.107849 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1895  50S ribosomal protein L11  61.22 
 
 		 149 aa  183  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00848778  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0312  ribosomal protein L11  60 
 
 		 143 aa  183  7e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000294677  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00692  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 148 aa  183  8e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2200  50S ribosomal protein L11  60.71 
 
 		 169 aa  182  9e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723697  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0202  50S ribosomal protein L11  62.68 
 
 		 142 aa  183  9e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000393914  hitchhiker  0.0000945283 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0335  50S ribosomal protein L11  60 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00120454  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0201  50S ribosomal protein L11  61.27 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3864  50S ribosomal protein L11  60 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000881502  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0220  50S ribosomal protein L11  61.97 
 
 		 142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0498  ribosomal protein L11  61.27 
 
 		 142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3735  ribosomal protein L11  61.27 
 
 		 142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.257354  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0836  50S ribosomal protein L11P  59.86 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00174211  normal  0.0898369 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0708  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 143 aa  182  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0465712  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3770  50S ribosomal protein L11  61.97 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000004485  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0920  50S ribosomal protein L11  61.87 
 
 		 143 aa  181  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000795353  hitchhiker  0.00000174139 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0193  50S ribosomal protein L11  59.86 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000186819  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0188  50S ribosomal protein L11  61.97 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000110697  hitchhiker  0.00720013 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0183  50S ribosomal protein L11  61.97 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal  0.0105542 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0188  50S ribosomal protein L11  61.97 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000143261  hitchhiker  0.00929078 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0273  ribosomal protein L11  60.56 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225698  normal  0.023291 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0642  50S ribosomal protein L11  59.15 
 
 		 141 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0270272  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0410  50S ribosomal protein L11  61.43 
 
 		 143 aa  181  4.0000000000000006e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0119247  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0922  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 		 140 aa  180  5.0000000000000004e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3339  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 		 140 aa  180  5.0000000000000004e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131988 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0206  50S ribosomal protein L11  60.56 
 
 		 142 aa  180  6e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000183959  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3450  ribosomal protein L11  61.43 
 
 		 153 aa  180  6e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0033133  normal  0.0131963 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03859  50S ribosomal protein L11  59.15 
 
 		 142 aa  180  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000538182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4012  ribosomal protein L11  59.15 
 
 		 142 aa  180  8.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000866586  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4216  50S ribosomal protein L11  59.15 
 
 		 142 aa  180  8.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.8656399999999995e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4481  50S ribosomal protein L11  59.15 
 
 		 142 aa  180  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0148745  decreased coverage  0.00000000000000460315 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4359  50S ribosomal protein L11  59.15 
 
 		 142 aa  180  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00156245  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0366  50S ribosomal protein L11  58.5 
 
 		 149 aa  180  8.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205426  normal  0.556831 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4042  50S ribosomal protein L11  59.15 
 
 		 142 aa  180  8.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000015229  hitchhiker  0.00267408 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4431  50S ribosomal protein L11  59.15 
 
 		 142 aa  180  8.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000394212  hitchhiker  0.00000226734 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4523  50S ribosomal protein L11  59.15 
 
 		 142 aa  180  8.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000459439  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4478  50S ribosomal protein L11  59.15 
 
 		 142 aa  180  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00436527  hitchhiker  0.00122683 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4391  50S ribosomal protein L11  59.15 
 
 		 142 aa  180  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058803  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4555  50S ribosomal protein L11  59.15 
 
 		 142 aa  180  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.011622  hitchhiker  0.000000000000800119 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4471  50S ribosomal protein L11  59.15 
 
 		 142 aa  180  8.000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000366824  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03812  hypothetical protein  59.15 
 
 		 142 aa  180  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000676745  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5448  50S ribosomal protein L11  59.15 
 
 		 142 aa  180  8.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000790923  hitchhiker  0.00174431 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2111  50S ribosomal protein L11  59.86 
 
 		 169 aa  179  9.000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000939777  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3889  ribosomal protein L11  60.56 
 
 		 142 aa  179  9.000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0323173  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0745  50S ribosomal protein L11  61.27 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00286512  normal  0.949117 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0308  50S ribosomal protein L11  61.43 
 
 		 143 aa  179  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00601669  normal  0.0251359 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 143 aa  179  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4067  50S ribosomal protein L11  61.27 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000738162  hitchhiker  0.00970321 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0847  50S ribosomal protein L11  57.75 
 
 		 141 aa  178  2e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000114172  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4471  50S ribosomal protein L11  61.27 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0185  50S ribosomal protein L11  61.27 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166611  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0189  50S ribosomal protein L11  61.27 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000123939  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0584  50S ribosomal protein L11  60.71 
 
 		 143 aa  178  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  60.71 
 
 		 141 aa  179  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4701  50S ribosomal protein L11  60.71 
 
 		 142 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000419074  hitchhiker  0.00000427936 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0173  50S ribosomal protein L11  60.71 
 
 		 142 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239695  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3644  50S ribosomal protein L11  60.71 
 
 		 144 aa  177  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.416555 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1703  50S ribosomal protein L11  59.46 
 
 		 150 aa  177  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.978743  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4328  50S ribosomal protein L11  60.71 
 
 		 142 aa  177  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000353515  hitchhiker  0.00000000170841 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0147  50S ribosomal protein L11  60.71 
 
 		 142 aa  177  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000977469  normal  0.034689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>