More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0743 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0743  50S ribosomal protein L11  100 
 
 		 150 aa  301  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0168765 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0563  50S ribosomal protein L11  82 
 
 		 150 aa  256  7e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2546  50S ribosomal protein L11  78.67 
 
 		 150 aa  244  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0349  50S ribosomal protein L11  77.33 
 
 		 150 aa  243  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.720013  normal  0.954559 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0335  50S ribosomal protein L11  77.33 
 
 		 150 aa  243  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.108088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1703  50S ribosomal protein L11  77.33 
 
 		 150 aa  243  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.978743  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0229  50S ribosomal protein L11  75.84 
 
 		 141 aa  228  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0737159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0260  50S ribosomal protein L11  72.48 
 
 		 141 aa  221  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1823  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 142 aa  211  3.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.135034  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1209  50S ribosomal protein L11  69.33 
 
 		 142 aa  210  4.9999999999999996e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1248  50S ribosomal protein L11  68.67 
 
 		 142 aa  209  7e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.208102  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1943  50S ribosomal protein L11  67.33 
 
 		 142 aa  209  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0464106  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0567  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 142 aa  201  2e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000313352  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3472  50S ribosomal protein L11  65.33 
 
 		 142 aa  201  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.275844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2725  50S ribosomal protein L11  65.54 
 
 		 142 aa  199  8e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.053271  normal  0.344751 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2277  50S ribosomal protein L11  64 
 
 		 142 aa  199  9e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0974  50S ribosomal protein L11  64 
 
 		 142 aa  198  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0169903 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3201  50S ribosomal protein L11  63.33 
 
 		 142 aa  197  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1806  50S ribosomal protein L11  64.86 
 
 		 142 aa  198  3e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.785581  normal  0.199785 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5087  50S ribosomal protein L11  64 
 
 		 142 aa  197  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0150529  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3692  50S ribosomal protein L11  64 
 
 		 142 aa  196  7e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1819  50S ribosomal protein L11  65.56 
 
 		 143 aa  196  7.999999999999999e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.674274  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1346  50S ribosomal protein L11  64.19 
 
 		 142 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1418  50S ribosomal protein L11  64.9 
 
 		 143 aa  194  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.816838  normal  0.409457 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1527  50S ribosomal protein L11  64.19 
 
 		 142 aa  195  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1320  50S ribosomal protein L11  64.9 
 
 		 143 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.458077  normal  0.354215 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1062  ribosomal protein L11  64.67 
 
 		 143 aa  193  6e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0402568  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2699  50S ribosomal protein L11  61.49 
 
 		 142 aa  193  6e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3360  50S ribosomal protein L11  62.91 
 
 		 149 aa  192  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.711541  normal  0.0993173 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  64 
 
 		 143 aa  191  3e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0755  50S ribosomal protein L11  64.67 
 
 		 143 aa  191  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0833  50S ribosomal protein L11  61.49 
 
 		 143 aa  191  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.714386  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0920  50S ribosomal protein L11  63.33 
 
 		 143 aa  191  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000795353  hitchhiker  0.00000174139 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06120  50S ribosomal protein L11  62.67 
 
 		 143 aa  190  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2335  50S ribosomal protein L11  62.67 
 
 		 143 aa  190  5e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00025621  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00692  50S ribosomal protein L11  63.33 
 
 		 148 aa  190  6e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0284  ribosomal protein L11  63.33 
 
 		 142 aa  190  6e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000710656  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1895  50S ribosomal protein L11  63.58 
 
 		 149 aa  189  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00848778  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2335  50S ribosomal protein L11  63.33 
 
 		 143 aa  189  8e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345629  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0237  50S ribosomal protein L11  64.67 
 
 		 143 aa  189  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.0118731 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3450  ribosomal protein L11  64.67 
 
 		 153 aa  189  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0033133  normal  0.0131963 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4287  50S ribosomal protein L11  62.67 
 
 		 144 aa  189  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000848232  hitchhiker  0.000000453889 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0745  50S ribosomal protein L11  62.67 
 
 		 142 aa  188  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00286512  normal  0.949117 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3758  50S ribosomal protein L11  64.67 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00142247  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4773  50S ribosomal protein L11  63.76 
 
 		 142 aa  189  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0832253  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2645  50S ribosomal protein L11  64.67 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0183792  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2563  50S ribosomal protein L11  59.46 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3790  50S ribosomal protein L11  64.67 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3820  50S ribosomal protein L11  64.67 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3080  50S ribosomal protein L11  64.67 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0312  ribosomal protein L11  61.33 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000294677  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1442  50S ribosomal protein L11  61.49 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.337085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3182  50S ribosomal protein L11  64.67 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000133089  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0594  ribosomal protein L11  63.33 
 
 		 142 aa  188  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000269533  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3864  50S ribosomal protein L11  60.67 
 
 		 142 aa  189  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.094811 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3349  ribosomal protein L11  63.33 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.533999  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1910  50S ribosomal protein L11  64.67 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000051235  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3465  50S ribosomal protein L11  64.67 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108139  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0264  50S ribosomal protein L11  64 
 
 		 143 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0928671  normal  0.597405 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4479  50S ribosomal protein L11  63.09 
 
 		 149 aa  187  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.116723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4367  50S ribosomal protein L11  63.09 
 
 		 149 aa  187  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3998  50S ribosomal protein L11  63.09 
 
 		 149 aa  187  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.748509  normal  0.915544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3844  50S ribosomal protein L11  63.09 
 
 		 149 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.638614 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0255  50S ribosomal protein L11  64 
 
 		 143 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0246755  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3920  50S ribosomal protein L11  62.67 
 
 		 143 aa  187  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.848211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3435  50S ribosomal protein L11  63.33 
 
 		 143 aa  187  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0613372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0315  50S ribosomal protein L11  63.33 
 
 		 143 aa  187  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000167318  normal  0.214276 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2771  50S ribosomal protein L11  63.33 
 
 		 143 aa  187  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0336  50S ribosomal protein L11  63.33 
 
 		 143 aa  187  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0811079  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0202  50S ribosomal protein L11  61.07 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000393914  hitchhiker  0.0000945283 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0220  50S ribosomal protein L11  60 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0188  50S ribosomal protein L11  60 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000110697  hitchhiker  0.00720013 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0183  50S ribosomal protein L11  60 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal  0.0105542 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0188  50S ribosomal protein L11  60 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000143261  hitchhiker  0.00929078 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2971  50S ribosomal protein L11  63.33 
 
 		 143 aa  186  8e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.621539 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3318  50S ribosomal protein L11  63.33 
 
 		 143 aa  186  8e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0826  50S ribosomal protein L11  61.33 
 
 		 143 aa  186  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0222387  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3770  50S ribosomal protein L11  59.73 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000004485  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0366  50S ribosomal protein L11  60.93 
 
 		 149 aa  186  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205426  normal  0.556831 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3038  50S ribosomal protein L11  63.33 
 
 		 143 aa  186  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0450649 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0268  50S ribosomal protein L11P  62.67 
 
 		 143 aa  185  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00815832  hitchhiker  0.0013988 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3338  50S ribosomal protein L11  63.33 
 
 		 143 aa  186  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  62 
 
 		 143 aa  186  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08720  50S ribosomal protein L11  61.33 
 
 		 143 aa  186  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444282  hitchhiker  0.00204472 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0038  50S ribosomal protein L11  61.33 
 
 		 143 aa  186  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000123599  hitchhiker  0.0000000000171978 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0042  50S ribosomal protein L11  62 
 
 		 143 aa  186  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000150349  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0708  50S ribosomal protein L11  62.67 
 
 		 143 aa  186  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0465712  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0443  50S ribosomal protein L11  61.33 
 
 		 143 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273232  unclonable  0.00000025949 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0615  ribosomal protein L11  61.33 
 
 		 143 aa  185  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.956774  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0476  50S ribosomal protein L11  61.33 
 
 		 143 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000067383  normal  0.0123717 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4559  50S ribosomal protein L11  61.33 
 
 		 143 aa  185  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275981  normal  0.0500923 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3193  50S ribosomal protein L11  63.33 
 
 		 143 aa  185  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.177211  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5090  50S ribosomal protein L11  60.67 
 
 		 143 aa  185  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000105007  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4435  50S ribosomal protein L11  60.14 
 
 		 143 aa  185  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0473  50S ribosomal protein L11  61.33 
 
 		 143 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.015667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2852  50S ribosomal protein L11  62 
 
 		 143 aa  185  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393005  normal  0.399654 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4760  50S ribosomal protein L11  61.33 
 
 		 143 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000974914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2806  50S ribosomal protein L11  61.33 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221343  normal  0.107849 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2726  50S ribosomal protein L11  60 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093206  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0410  50S ribosomal protein L11  61.33 
 
 		 143 aa  184  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0119247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>