More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_R0036 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_R0051  23S ribosomal RNA  99.9 
 
 		 2936 bp  5796    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0008  23S ribosomal RNA  99.93 
 
 		 2936 bp  5804    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.175308  normal  0.0232051 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0036  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2936 bp  5820    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.292876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0051  23S ribosomal RNA  87.38 
 
 		 2923 bp  1057    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.467904  normal  0.0147394 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0038  23S ribosomal RNA  87.38 
 
 		 2923 bp  1057    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.640363  normal  0.0435947 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0017  23S ribosomal RNA  87.97 
 
 		 2961 bp  985    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150886 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0033  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 		 2961 bp  993    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0018  23S ribosomal RNA  85.41 
 
 		 2934 bp  626  1e-177  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0036  23S ribosomal RNA  85.41 
 
 		 2934 bp  626  1e-177  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0056  23S ribosomal RNA  87.75 
 
 		 2596 bp  537  1e-150  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0250368  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0046  23S ribosomal RNA  87.75 
 
 		 2596 bp  537  1e-150  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.270157  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0029  23S ribosomal RNA  87.75 
 
 		 2597 bp  537  1e-150  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0204642  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0020  23S ribosomal RNA  87.75 
 
 		 2596 bp  537  1e-150  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.552438  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0039  23S ribosomal RNA  87.75 
 
 		 2596 bp  537  1e-150  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.787609  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0015  23S ribosomal RNA  85.94 
 
 		 2972 bp  327  9.999999999999999e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.544354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0001  23S ribosomal RNA  85.35 
 
 		 2954 bp  325  3.9999999999999996e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00828504  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07450  23S ribosomal RNA  85.18 
 
 		 3130 bp  321  7e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.982491 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25520  23S ribosomal RNA  85.18 
 
 		 3130 bp  321  7e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05570  23S ribosomal RNA  85.18 
 
 		 3130 bp  321  7e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0023  23S ribosomal RNA  85.68 
 
 		 2925 bp  319  2.9999999999999996e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0220545  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0028  23S ribosomal RNA  85.68 
 
 		 2925 bp  319  2.9999999999999996e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0156904  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0004  23S ribosomal RNA  85.68 
 
 		 2925 bp  319  2.9999999999999996e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180219  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0055  23S ribosomal RNA  85.68 
 
 		 2925 bp  319  2.9999999999999996e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.125103  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_De23S  23S ribosomal RNA  85.1 
 
 		 2949 bp  317  1e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0999711  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_54  23S ribosomal RNA  85.1 
 
 		 2945 bp  317  1e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00112496  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0045  23S ribosomal RNA  84.67 
 
 		 3088 bp  305  4e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000567155  hitchhiker  0.00126487 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0048  23S ribosomal RNA  84.67 
 
 		 3088 bp  305  4e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000200922  hitchhiker  0.000167099 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0010  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 		 2944 bp  301  6e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.142358  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0050  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 		 2946 bp  301  6e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.074771  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0028  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 		 2946 bp  301  6e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0002  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 		 2944 bp  301  6e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0115093  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0059  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 		 2943 bp  301  6e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.12329  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0031  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 		 2946 bp  301  6e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.196747  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0009  23S ribosomal RNA  84.92 
 
 		 2912 bp  297  9e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.363949  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0036  23S ribosomal RNA  85.23 
 
 		 2934 bp  297  9e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0079  23S ribosomal RNA  84.92 
 
 		 2913 bp  297  9e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.354766  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0014  23S ribosomal RNA  85.31 
 
 		 2942 bp  293  1e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000648594  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0025  23S ribosomal RNA  85.31 
 
 		 2942 bp  293  1e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0030  23S ribosomal RNA  85.31 
 
 		 2942 bp  293  1e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0046  23S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 3125 bp  291  5.999999999999999e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0442831  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07390  23S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 3086 bp  291  5.999999999999999e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.170063  normal  0.154032 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0051  23S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 3125 bp  291  5.999999999999999e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00166158  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0030  23S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 3125 bp  291  5.999999999999999e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00123294  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0014  23S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 3125 bp  291  5.999999999999999e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12350  23S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 3086 bp  291  5.999999999999999e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.102229  normal  0.0554684 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0054  23S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 2933 bp  289  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0042  23S ribosomal RNA  84.97 
 
 		 2936 bp  289  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000650821 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0079  23S ribosomal RNA  84.97 
 
 		 2935 bp  289  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0050  23S ribosomal RNA  84.97 
 
 		 2935 bp  289  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.617817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0044  23S ribosomal RNA  84.86 
 
 		 2873 bp  289  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.223039  normal  0.259444 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0043  23S ribosomal RNA  84.86 
 
 		 2873 bp  289  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0027  23S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 2933 bp  289  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.373876  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0118  23S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 2933 bp  289  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0016  23S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 2933 bp  289  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0203947  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0064  23S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 2912 bp  289  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00853635  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0092  23S ribosomal RNA  84.97 
 
 		 2935 bp  289  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0059  23S ribosomal RNA  84.97 
 
 		 2935 bp  289  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0882856  normal  0.887302 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0020  23S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 3062 bp  289  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000158535  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0022  23S ribosomal RNA  84.86 
 
 		 2873 bp  289  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0071  23S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 2912 bp  289  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.19372  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0059  23S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 2935 bp  289  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0099  23S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 2933 bp  289  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00331289  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0030  23S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 2933 bp  289  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0004  23S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 2933 bp  289  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0062  23S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 2932 bp  289  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0011  23S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 2933 bp  289  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0045  23S ribosomal RNA  84.97 
 
 		 2976 bp  289  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.570059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0021  23S ribosomal RNA  84.86 
 
 		 2873 bp  289  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380861  normal  0.0691187 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0068  23S ribosomal RNA  84.97 
 
 		 2935 bp  289  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.502369 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rrlVIMSS1365779  23S ribosomal RNA  84.86 
 
 		 2875 bp  289  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.069762 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0063  23S ribosomal RNA  84.97 
 
 		 2976 bp  289  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0010  23S ribosomal RNA  84.97 
 
 		 2934 bp  289  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.625717 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10560  23S ribosomal RNA  84.38 
 
 		 3113 bp  285  4e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.491594  normal  0.443852 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22210  23S ribosomal RNA  84.38 
 
 		 3113 bp  285  4e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.790169  normal  0.277767 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06920  23S ribosomal RNA  84.38 
 
 		 3113 bp  285  4e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37130  23S ribosomal RNA  84.38 
 
 		 3113 bp  285  4e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.756619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0011  23S ribosomal RNA  84.09 
 
 		 3529 bp  285  4e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0016  23S ribosomal RNA  84.09 
 
 		 3088 bp  285  4e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0021  23S ribosomal RNA  84.09 
 
 		 3260 bp  285  4e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SA  23S ribosomal RNA  84.33 
 
 		 2903 bp  283  1e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SB  23S ribosomal RNA  84.33 
 
 		 2903 bp  283  1e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.27693  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SC  23S ribosomal RNA  84.33 
 
 		 2903 bp  283  1e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SD  23S ribosomal RNA  84.33 
 
 		 2903 bp  283  1e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.635021  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SE  23S ribosomal RNA  84.33 
 
 		 2903 bp  283  1e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.651063  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SF  23S ribosomal RNA  84.33 
 
 		 2903 bp  283  1e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SG  23S ribosomal RNA  84.33 
 
 		 2903 bp  283  1e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0028  23S ribosomal RNA  83.96 
 
 		 3122 bp  283  1e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0006  23S ribosomal RNA  83.96 
 
 		 3121 bp  283  1e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0313545  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0016  23S ribosomal RNA  83.96 
 
 		 3108 bp  283  1e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0115492 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0049  23S ribosomal RNA  83.96 
 
 		 3121 bp  283  1e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.835565  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0026  23S ribosomal RNA  83.96 
 
 		 3108 bp  283  1e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0909246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0023  23S ribosomal RNA  84.33 
 
 		 3000 bp  283  1e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0035  23S ribosomal RNA  83.96 
 
 		 3147 bp  283  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0052  23S ribosomal RNA  83.96 
 
 		 3147 bp  283  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0059  23S ribosomal RNA  83.96 
 
 		 3147 bp  283  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0062  23S ribosomal RNA  83.96 
 
 		 3147 bp  283  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-5  23S ribosomal RNA  84.39 
 
 		 2911 bp  281  6e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-6  23S ribosomal RNA  84.39 
 
 		 2911 bp  281  6e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0028  23S ribosomal RNA  83.92 
 
 		 3087 bp  281  6e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00806626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SB  23S ribosomal RNA  84.39 
 
 		 2908 bp  281  6e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>