More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_R0051 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_R0051  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2923 bp  5794    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.467904  normal  0.0147394 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0008  23S ribosomal RNA  87.38 
 
 		 2936 bp  1057    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.175308  normal  0.0232051 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0018  23S ribosomal RNA  85.98 
 
 		 2934 bp  664    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0051  23S ribosomal RNA  87.38 
 
 		 2936 bp  1057    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0036  23S ribosomal RNA  87.38 
 
 		 2936 bp  1057    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.292876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0036  23S ribosomal RNA  85.98 
 
 		 2934 bp  664    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0038  23S ribosomal RNA  99.97 
 
 		 2923 bp  5786    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.640363  normal  0.0435947 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0017  23S ribosomal RNA  94.06 
 
 		 2961 bp  4351    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150886 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0033  23S ribosomal RNA  94.06 
 
 		 2961 bp  4351    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0039  23S ribosomal RNA  85.92 
 
 		 2596 bp  458  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.787609  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0020  23S ribosomal RNA  85.92 
 
 		 2596 bp  458  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.552438  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0056  23S ribosomal RNA  85.92 
 
 		 2596 bp  458  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0250368  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0046  23S ribosomal RNA  85.92 
 
 		 2596 bp  458  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.270157  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0029  23S ribosomal RNA  85.92 
 
 		 2597 bp  458  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0204642  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0066  23S ribosomal RNA  88.1 
 
 		 2927 bp  392  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0004  23S ribosomal RNA  88.1 
 
 		 2928 bp  392  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0027  23S ribosomal RNA  88.1 
 
 		 2927 bp  392  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0113  23S ribosomal RNA  88.1 
 
 		 2927 bp  392  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0070  23S ribosomal RNA  88.1 
 
 		 2927 bp  392  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0010  23S ribosomal RNA  88.1 
 
 		 2927 bp  392  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0037  23S ribosomal RNA  88.1 
 
 		 2927 bp  392  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0024  23S ribosomal RNA  88.1 
 
 		 2927 bp  392  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0028  23S ribosomal RNA  88.03 
 
 		 2946 bp  389  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0002  23S ribosomal RNA  88.03 
 
 		 2944 bp  389  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0115093  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0031  23S ribosomal RNA  88.03 
 
 		 2946 bp  389  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.196747  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0010  23S ribosomal RNA  88.03 
 
 		 2944 bp  389  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.142358  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0005  23S ribosomal RNA  88.11 
 
 		 2878 bp  385  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00100489  normal  0.226788 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0051  23S ribosomal RNA  88.11 
 
 		 2878 bp  385  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00795869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rrlVIMSS1365779  23S ribosomal RNA  88.11 
 
 		 2875 bp  385  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.069762 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0059  23S ribosomal RNA  87.77 
 
 		 2943 bp  381  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.12329  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0050  23S ribosomal RNA  87.77 
 
 		 2946 bp  381  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.074771  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0001  23S ribosomal RNA  87.12 
 
 		 2954 bp  381  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00828504  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0059  23S ribosomal RNA  87.57 
 
 		 2935 bp  377  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0011  23S ribosomal RNA  87.57 
 
 		 2933 bp  377  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0118  23S ribosomal RNA  87.57 
 
 		 2933 bp  377  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0030  23S ribosomal RNA  87.57 
 
 		 2933 bp  377  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0016  23S ribosomal RNA  87.57 
 
 		 2933 bp  377  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0203947  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0004  23S ribosomal RNA  87.57 
 
 		 2933 bp  377  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0054  23S ribosomal RNA  87.57 
 
 		 2933 bp  377  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0027  23S ribosomal RNA  87.57 
 
 		 2933 bp  377  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.373876  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0099  23S ribosomal RNA  87.57 
 
 		 2933 bp  377  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00331289  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0062  23S ribosomal RNA  87.57 
 
 		 2932 bp  377  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_De23S  23S ribosomal RNA  86.87 
 
 		 2949 bp  373  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0999711  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_54  23S ribosomal RNA  86.87 
 
 		 2945 bp  373  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00112496  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0016  23S ribosomal RNA  86.72 
 
 		 3108 bp  371  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0115492 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0026  23S ribosomal RNA  86.72 
 
 		 3108 bp  371  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0909246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0012  23S ribosomal RNA  87.57 
 
 		 2874 bp  369  3e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_rrlVIMSS1365722  23S ribosomal RNA  87.57 
 
 		 2876 bp  369  3e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_rrlVIMSS1365720  23S ribosomal RNA  87.57 
 
 		 2874 bp  369  3e-99  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.576306  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_rrlVIMSS1365721  23S ribosomal RNA  87.57 
 
 		 2874 bp  369  3e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.19888  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0015  23S ribosomal RNA  86.65 
 
 		 2972 bp  367  1e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.544354  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SA  23S ribosomal RNA  86.95 
 
 		 2903 bp  363  1.9999999999999998e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SB  23S ribosomal RNA  86.95 
 
 		 2903 bp  363  1.9999999999999998e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.27693  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SC  23S ribosomal RNA  86.95 
 
 		 2903 bp  363  1.9999999999999998e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SD  23S ribosomal RNA  86.95 
 
 		 2903 bp  363  1.9999999999999998e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.635021  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SE  23S ribosomal RNA  86.95 
 
 		 2903 bp  363  1.9999999999999998e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.651063  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SF  23S ribosomal RNA  86.95 
 
 		 2903 bp  363  1.9999999999999998e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SG  23S ribosomal RNA  86.95 
 
 		 2903 bp  363  1.9999999999999998e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_rrlVIMSS1365801  23S ribosomal RNA  87.3 
 
 		 2876 bp  361  7.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.646586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0348  23S ribosomal RNA  87.04 
 
 		 2909 bp  361  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0669786  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rrlVIMSS1365778  23S ribosomal RNA  87.84 
 
 		 2873 bp  361  7.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06920  23S ribosomal RNA  86.72 
 
 		 3113 bp  357  1e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37130  23S ribosomal RNA  86.72 
 
 		 3113 bp  357  1e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.756619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10560  23S ribosomal RNA  86.72 
 
 		 3113 bp  357  1e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.491594  normal  0.443852 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22210  23S ribosomal RNA  86.72 
 
 		 3113 bp  357  1e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.790169  normal  0.277767 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0023  23S ribosomal RNA  85.09 
 
 		 3000 bp  357  1e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0006  23S ribosomal RNA  86.22 
 
 		 3121 bp  355  5e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0313545  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0049  23S ribosomal RNA  86.22 
 
 		 3121 bp  355  5e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.835565  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0028  23S ribosomal RNA  86.22 
 
 		 3122 bp  355  5e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0066  23S ribosomal RNA  86.77 
 
 		 2907 bp  353  2e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0141  23S ribosomal RNA  86.77 
 
 		 2907 bp  353  2e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.030132  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5745  23S ribosomal RNA  86.77 
 
 		 2909 bp  353  2e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00582654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5748  23S ribosomal RNA  86.77 
 
 		 2908 bp  353  2e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014193  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5751  23S ribosomal RNA  86.77 
 
 		 2909 bp  353  2e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5754  23S ribosomal RNA  86.77 
 
 		 2909 bp  353  2e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-1  23S ribosomal RNA  86.77 
 
 		 2911 bp  353  2e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-10  23S ribosomal RNA  86.77 
 
 		 2911 bp  353  2e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-11  23S ribosomal RNA  86.77 
 
 		 2911 bp  353  2e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0010  23S ribosomal RNA  86.77 
 
 		 2925 bp  353  2e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_2  23S ribosomal RNA  86.77 
 
 		 2911 bp  353  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_5  23S ribosomal RNA  86.77 
 
 		 2911 bp  353  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.759228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_6  23S ribosomal RNA  86.77 
 
 		 2911 bp  353  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_7  23S ribosomal RNA  86.77 
 
 		 2911 bp  353  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_8  23S ribosomal RNA  86.77 
 
 		 2911 bp  353  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_9  23S ribosomal RNA  86.77 
 
 		 2912 bp  353  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_1  23S ribosomal RNA  86.77 
 
 		 2911 bp  353  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_10  23S ribosomal RNA  86.77 
 
 		 2911 bp  353  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_11  23S ribosomal RNA  86.77 
 
 		 2911 bp  353  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.701116  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_12  23S ribosomal RNA  86.77 
 
 		 2911 bp  353  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_13  23S ribosomal RNA  86.77 
 
 		 2911 bp  353  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_2  23S ribosomal RNA  86.77 
 
 		 2911 bp  353  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_3  23S ribosomal RNA  86.77 
 
 		 2911 bp  353  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_4  23S ribosomal RNA  86.77 
 
 		 2911 bp  353  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0824907  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_5  23S ribosomal RNA  86.77 
 
 		 2911 bp  353  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_6  23S ribosomal RNA  86.77 
 
 		 2911 bp  353  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0091  23S ribosomal RNA  86.77 
 
 		 2907 bp  353  2e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109092  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0025  23S ribosomal RNA  86.77 
 
 		 2925 bp  353  2e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.610781  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0069  23S ribosomal RNA  86.77 
 
 		 2908 bp  353  2e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0072  23S ribosomal RNA  86.77 
 
 		 2907 bp  353  2e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000119646  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0049  23S ribosomal RNA  86.77 
 
 		 2925 bp  353  2e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>