More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_R0001 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET_De23S  23S ribosomal RNA  98.91 
 
 		 2949 bp  5590    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0999711  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_54  23S ribosomal RNA  98.91 
 
 		 2945 bp  5584    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00112496  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r0450  23S ribosomal RNA  84.01 
 
 		 2632 bp  698    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.226128 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1565  23S ribosomal RNA  84.01 
 
 		 2631 bp  698    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1798  23S ribosomal RNA  83.91 
 
 		 2631 bp  690    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  9.25169e-21 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1804  23S ribosomal RNA  83.91 
 
 		 2631 bp  690    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000784168 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1619  23S ribosomal RNA  84.01 
 
 		 2631 bp  698    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.20169 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0001  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2954 bp  5856    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00828504  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1584  23S ribosomal RNA  84.01 
 
 		 2631 bp  698    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0054  23S ribosomal RNA segment  82.85 
 
 		 3298 bp  599  1e-168  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.26274  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0008  23S ribosomal RNA segment  82.85 
 
 		 3298 bp  599  1e-168  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0049  23S ribosomal RNA segment  82.85 
 
 		 3298 bp  599  1e-168  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.587428  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0030  23S ribosomal RNA segment  82.85 
 
 		 3298 bp  599  1e-168  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00296414  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0008  23S ribosomal RNA  82.83 
 
 		 3357 bp  595  1e-167  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.651179  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0031  23S ribosomal RNA  82.83 
 
 		 3357 bp  595  1e-167  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0079  23S ribosomal RNA  84.15 
 
 		 2935 bp  593  1e-166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0068  23S ribosomal RNA  84.27 
 
 		 2935 bp  591  1e-166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.502369 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0050  23S ribosomal RNA  84.27 
 
 		 2935 bp  591  1e-166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.617817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0045  23S ribosomal RNA  84.15 
 
 		 2976 bp  593  1e-166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.570059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0092  23S ribosomal RNA  82.71 
 
 		 2935 bp  589  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0042  23S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 2936 bp  585  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000650821 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0059  23S ribosomal RNA  84.15 
 
 		 2935 bp  583  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0882856  normal  0.887302 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0010  23S ribosomal RNA  83.92 
 
 		 2934 bp  577  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.625717 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0063  23S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 2976 bp  575  1e-161  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0069  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2908 bp  502  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0031  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2907 bp  502  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000296907  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0028  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2907 bp  502  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0072  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2907 bp  502  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000119646  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0066  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2907 bp  502  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0016  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2907 bp  502  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.921086  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5739  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2908 bp  502  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5742  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2908 bp  502  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5745  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2909 bp  502  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00582654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5748  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2908 bp  502  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014193  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5751  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2909 bp  502  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5754  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2909 bp  502  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5757  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2908 bp  502  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5760  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2908 bp  502  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5766  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2908 bp  502  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000129923  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5769  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2908 bp  502  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00191145  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0004  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2908 bp  502  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0141  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2907 bp  502  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.030132  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0066  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2908 bp  502  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0028  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2908 bp  502  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0095  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2908 bp  502  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00287341  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0075  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2908 bp  502  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0455984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0145  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2908 bp  502  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0192013  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-1  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2911 bp  502  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-10  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2911 bp  502  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-11  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2911 bp  502  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-2  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2911 bp  502  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-3  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2851 bp  502  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-4  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2911 bp  502  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-5  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2911 bp  502  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-8  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2911 bp  502  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0034  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2909 bp  502  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_1  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2912 bp  502  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_10  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2912 bp  502  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_11  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2911 bp  502  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_12  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2911 bp  502  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_13  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2911 bp  502  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_2  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2911 bp  502  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_3  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2911 bp  502  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_4  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2911 bp  502  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_5  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2911 bp  502  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.759228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_6  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2911 bp  502  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_7  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2911 bp  502  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_8  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2911 bp  502  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_9  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2912 bp  502  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_1  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2911 bp  502  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_10  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2911 bp  502  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_11  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2911 bp  502  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.701116  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_12  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2911 bp  502  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_13  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2911 bp  502  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_2  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2911 bp  502  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_3  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2911 bp  502  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_4  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2911 bp  502  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0824907  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_5  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2911 bp  502  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_6  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2911 bp  502  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0010  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2909 bp  502  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0263199  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_8  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2911 bp  502  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_9  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2912 bp  502  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SE  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2908 bp  502  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.842717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SF  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2908 bp  502  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SJ  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2908 bp  502  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00026047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SK  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2908 bp  502  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00794568  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0091  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2907 bp  502  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109092  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0055  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2908 bp  502  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0016  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2908 bp  502  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0031  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2908 bp  502  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0455984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0060  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2908 bp  502  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0069  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2908 bp  502  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0072  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2908 bp  502  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0063  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2908 bp  502  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0011  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2907 bp  502  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0011  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2908 bp  502  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0063  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2908 bp  502  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0004  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2908 bp  502  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0055  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2907 bp  502  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.940507  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0060  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2908 bp  502  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>