More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_R0018 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_R0051  23S ribosomal RNA  85.98 
 
 		 2923 bp  664    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.467904  normal  0.0147394 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0036  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2934 bp  5816    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0018  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2934 bp  5816    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0038  23S ribosomal RNA  85.98 
 
 		 2923 bp  664    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.640363  normal  0.0435947 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0017  23S ribosomal RNA  86.24 
 
 		 2961 bp  698    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150886 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0033  23S ribosomal RNA  86.24 
 
 		 2961 bp  698    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0008  23S ribosomal RNA  85.41 
 
 		 2936 bp  626  1e-177  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.175308  normal  0.0232051 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0051  23S ribosomal RNA  85.41 
 
 		 2936 bp  626  1e-177  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0036  23S ribosomal RNA  85.41 
 
 		 2936 bp  626  1e-177  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.292876  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0056  23S ribosomal RNA  82.6 
 
 		 2881 bp  505  1e-140  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.040674  normal  0.194339 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0006  23S ribosomal RNA  82.6 
 
 		 2881 bp  505  1e-140  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0316316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0015  23S ribosomal RNA  86.8 
 
 		 2972 bp  496  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.544354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0010  23S ribosomal RNA  86.68 
 
 		 2927 bp  486  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0004  23S ribosomal RNA  86.68 
 
 		 2928 bp  486  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0037  23S ribosomal RNA  86.68 
 
 		 2927 bp  486  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0027  23S ribosomal RNA  86.68 
 
 		 2927 bp  486  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0070  23S ribosomal RNA  86.68 
 
 		 2927 bp  486  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0066  23S ribosomal RNA  86.68 
 
 		 2927 bp  486  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0024  23S ribosomal RNA  86.68 
 
 		 2927 bp  486  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0113  23S ribosomal RNA  86.68 
 
 		 2927 bp  486  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0031  23S ribosomal RNA  86.59 
 
 		 2946 bp  480  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.196747  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0002  23S ribosomal RNA  86.59 
 
 		 2944 bp  480  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0115093  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0028  23S ribosomal RNA  86.59 
 
 		 2946 bp  480  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0010  23S ribosomal RNA  86.59 
 
 		 2944 bp  480  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.142358  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0004  23S ribosomal RNA  86.26 
 
 		 3129 bp  476  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0027  23S ribosomal RNA  86.26 
 
 		 3129 bp  476  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.344785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0055  23S ribosomal RNA  86.26 
 
 		 3129 bp  476  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639179  decreased coverage  0.00060371 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0021  23S ribosomal RNA  87.68 
 
 		 3260 bp  474  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0017  23S ribosomal RNA  86.26 
 
 		 3129 bp  476  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.78829 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0011  23S ribosomal RNA  87.68 
 
 		 3529 bp  474  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0016  23S ribosomal RNA  87.68 
 
 		 3088 bp  474  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0059  23S ribosomal RNA  86.41 
 
 		 2943 bp  472  9.999999999999999e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.12329  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0050  23S ribosomal RNA  86.41 
 
 		 2946 bp  472  9.999999999999999e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.074771  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0054  23S ribosomal RNA  86.31 
 
 		 2933 bp  470  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0099  23S ribosomal RNA  86.31 
 
 		 2933 bp  470  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00331289  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0011  23S ribosomal RNA  86.31 
 
 		 2933 bp  470  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0027  23S ribosomal RNA  86.31 
 
 		 2933 bp  470  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.373876  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0016  23S ribosomal RNA  86.31 
 
 		 2933 bp  470  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0203947  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0062  23S ribosomal RNA  86.31 
 
 		 2932 bp  470  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0118  23S ribosomal RNA  86.31 
 
 		 2933 bp  470  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0059  23S ribosomal RNA  86.31 
 
 		 2935 bp  470  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0004  23S ribosomal RNA  86.31 
 
 		 2933 bp  470  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0030  23S ribosomal RNA  86.31 
 
 		 2933 bp  470  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2999  23S ribosomal RNA  88.02 
 
 		 2909 bp  466  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3002  23S ribosomal RNA  88.02 
 
 		 2908 bp  466  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3005  23S ribosomal RNA  88.02 
 
 		 2908 bp  466  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3008  23S ribosomal RNA  88.02 
 
 		 2908 bp  466  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3011  23S ribosomal RNA  88.02 
 
 		 2908 bp  466  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3014  23S ribosomal RNA  88.02 
 
 		 2908 bp  466  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3017  23S ribosomal RNA  88.02 
 
 		 2908 bp  466  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3020  23S ribosomal RNA  88.02 
 
 		 2907 bp  466  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r02  23S ribosomal RNA  88.02 
 
 		 2908 bp  466  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r05  23S ribosomal RNA  88.02 
 
 		 2908 bp  466  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r08  23S ribosomal RNA  88.02 
 
 		 2908 bp  466  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r11  23S ribosomal RNA  88.02 
 
 		 2908 bp  466  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r14  23S ribosomal RNA  88.02 
 
 		 2908 bp  466  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r17  23S ribosomal RNA  88.02 
 
 		 2908 bp  466  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r20  23S ribosomal RNA  88.02 
 
 		 2908 bp  466  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r23  23S ribosomal RNA  88.02 
 
 		 2908 bp  466  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r25  23S ribosomal RNA  88.02 
 
 		 2907 bp  466  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r29  23S ribosomal RNA  88.02 
 
 		 2907 bp  466  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0028  23S ribosomal RNA  87.39 
 
 		 2908 bp  460  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0069  23S ribosomal RNA  87.39 
 
 		 2908 bp  460  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0055  23S ribosomal RNA  87.39 
 
 		 2908 bp  460  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0031  23S ribosomal RNA  87.39 
 
 		 2908 bp  460  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0455984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0095  23S ribosomal RNA  87.39 
 
 		 2908 bp  460  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00287341  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0072  23S ribosomal RNA  87.39 
 
 		 2908 bp  460  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0016  23S ribosomal RNA  87.39 
 
 		 2908 bp  460  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0004  23S ribosomal RNA  87.39 
 
 		 2908 bp  460  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0011  23S ribosomal RNA  87.39 
 
 		 2908 bp  460  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0060  23S ribosomal RNA  87.39 
 
 		 2908 bp  460  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0066  23S ribosomal RNA  87.39 
 
 		 2908 bp  460  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0145  23S ribosomal RNA  87.39 
 
 		 2908 bp  460  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0192013  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0075  23S ribosomal RNA  87.39 
 
 		 2908 bp  460  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0455984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0063  23S ribosomal RNA  87.39 
 
 		 2908 bp  460  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0348  23S ribosomal RNA  87.39 
 
 		 2909 bp  460  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0669786  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0023  23S ribosomal RNA  86.51 
 
 		 3000 bp  458  1.0000000000000001e-126  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SA  23S ribosomal RNA  88.09 
 
 		 2903 bp  454  1e-125  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SB  23S ribosomal RNA  88.09 
 
 		 2903 bp  454  1e-125  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.27693  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SC  23S ribosomal RNA  88.09 
 
 		 2903 bp  454  1e-125  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SD  23S ribosomal RNA  88.09 
 
 		 2903 bp  454  1e-125  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.635021  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SE  23S ribosomal RNA  88.09 
 
 		 2903 bp  454  1e-125  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.651063  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SF  23S ribosomal RNA  88.09 
 
 		 2903 bp  454  1e-125  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SG  23S ribosomal RNA  88.09 
 
 		 2903 bp  454  1e-125  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0001  23S ribosomal RNA  89.14 
 
 		 2954 bp  454  1e-125  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00828504  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0055  23S ribosomal RNA  87.18 
 
 		 2907 bp  452  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.940507  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0031  23S ribosomal RNA  87.18 
 
 		 2907 bp  452  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000296907  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5757  23S ribosomal RNA  87.18 
 
 		 2908 bp  452  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5760  23S ribosomal RNA  87.18 
 
 		 2908 bp  452  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-10  23S ribosomal RNA  87.18 
 
 		 2911 bp  452  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-11  23S ribosomal RNA  87.18 
 
 		 2911 bp  452  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-2  23S ribosomal RNA  87.18 
 
 		 2911 bp  452  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-3  23S ribosomal RNA  87.18 
 
 		 2851 bp  452  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_11  23S ribosomal RNA  87.18 
 
 		 2911 bp  452  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.701116  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_2  23S ribosomal RNA  87.18 
 
 		 2911 bp  452  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_3  23S ribosomal RNA  87.18 
 
 		 2911 bp  452  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_4  23S ribosomal RNA  87.18 
 
 		 2911 bp  452  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0824907  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_5  23S ribosomal RNA  87.18 
 
 		 2911 bp  452  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_6  23S ribosomal RNA  87.18 
 
 		 2911 bp  452  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_8  23S ribosomal RNA  87.18 
 
 		 2911 bp  452  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>