More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_R0056 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_R0021  23S ribosomal RNA  89.85 
 
 		 2893 bp  1974    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000272892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0006  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2881 bp  5711    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0316316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0053  23S ribosomal RNA  89.85 
 
 		 2893 bp  1974    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00828042  normal  0.0734628 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0056  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2881 bp  5711    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.040674  normal  0.194339 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0018  23S ribosomal RNA  82.6 
 
 		 2934 bp  505  1e-140  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0036  23S ribosomal RNA  82.6 
 
 		 2934 bp  505  1e-140  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0008  23S ribosomal RNA  85.79 
 
 		 2890 bp  476  1.0000000000000001e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.112108  decreased coverage  0.00656926 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0063  23S ribosomal RNA  85.79 
 
 		 2890 bp  476  1.0000000000000001e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.300943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_R0066  23S ribosomal RNA  89.1 
 
 		 2885 bp  464  9.999999999999999e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0043  23S ribosomal RNA  89.1 
 
 		 2890 bp  464  9.999999999999999e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363579  decreased coverage  0.0035918 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0113  23S ribosomal RNA  79.88 
 
 		 2927 bp  444  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0020  23S ribosomal RNA  87.56 
 
 		 3062 bp  432  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000158535  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0079  23S ribosomal RNA  87.33 
 
 		 2913 bp  424  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.354766  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0064  23S ribosomal RNA  87.33 
 
 		 2912 bp  424  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00853635  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0071  23S ribosomal RNA  87.33 
 
 		 2912 bp  424  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.19372  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0009  23S ribosomal RNA  87.33 
 
 		 2912 bp  424  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.363949  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0387  23S ribosomal RNA  84.85 
 
 		 2889 bp  420  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0012  23S ribosomal RNA  84.85 
 
 		 2903 bp  420  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0249657 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3081  23S ribosomal RNA  84.85 
 
 		 2889 bp  420  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0049  23S ribosomal RNA  84.85 
 
 		 2903 bp  420  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.427794  normal  0.973719 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0040  23S ribosomal RNA  84.34 
 
 		 2883 bp  408  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0411  23S ribosomal RNA  84.67 
 
 		 2902 bp  406  9.999999999999999e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r1782  23S ribosomal RNA  84.67 
 
 		 2901 bp  406  9.999999999999999e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0021  23S ribosomal RNA  84.67 
 
 		 2902 bp  406  9.999999999999999e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0183  23S ribosomal RNA  84.67 
 
 		 2902 bp  406  9.999999999999999e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0170  23S ribosomal RNA  84.67 
 
 		 2902 bp  406  9.999999999999999e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0081  23S ribosomal RNA  84.67 
 
 		 2902 bp  406  9.999999999999999e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0035  23S ribosomal RNA  84.26 
 
 		 2861 bp  402  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.249297  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0042  23S ribosomal RNA  84.26 
 
 		 2861 bp  402  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0050  23S ribosomal RNA  84.26 
 
 		 2861 bp  402  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0010  23S ribosomal RNA  84.35 
 
 		 2944 bp  394  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.142358  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0002  23S ribosomal RNA  84.35 
 
 		 2944 bp  394  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0115093  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0031  23S ribosomal RNA  84.35 
 
 		 2946 bp  394  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.196747  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0028  23S ribosomal RNA  84.35 
 
 		 2946 bp  394  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0062  23S ribosomal RNA  84.34 
 
 		 2972 bp  391  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SA  23S ribosomal RNA  84.31 
 
 		 2903 bp  391  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SB  23S ribosomal RNA  84.31 
 
 		 2903 bp  391  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.27693  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SC  23S ribosomal RNA  84.31 
 
 		 2903 bp  391  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SD  23S ribosomal RNA  84.31 
 
 		 2903 bp  391  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.635021  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SE  23S ribosomal RNA  84.31 
 
 		 2903 bp  391  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.651063  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SF  23S ribosomal RNA  84.31 
 
 		 2903 bp  391  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SG  23S ribosomal RNA  84.31 
 
 		 2903 bp  391  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0059  23S ribosomal RNA  84.34 
 
 		 2972 bp  391  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0139247  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0032  23S ribosomal RNA  84.34 
 
 		 2972 bp  391  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.922889  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2999  23S ribosomal RNA  83.96 
 
 		 2909 bp  391  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3002  23S ribosomal RNA  83.96 
 
 		 2908 bp  391  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3005  23S ribosomal RNA  83.96 
 
 		 2908 bp  391  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3008  23S ribosomal RNA  83.96 
 
 		 2908 bp  391  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3011  23S ribosomal RNA  83.96 
 
 		 2908 bp  391  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3014  23S ribosomal RNA  83.96 
 
 		 2908 bp  391  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3017  23S ribosomal RNA  83.96 
 
 		 2908 bp  391  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3020  23S ribosomal RNA  83.96 
 
 		 2907 bp  391  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r02  23S ribosomal RNA  83.96 
 
 		 2908 bp  391  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r05  23S ribosomal RNA  83.96 
 
 		 2908 bp  391  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r08  23S ribosomal RNA  83.96 
 
 		 2908 bp  391  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r11  23S ribosomal RNA  83.96 
 
 		 2908 bp  391  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r14  23S ribosomal RNA  83.96 
 
 		 2908 bp  391  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r20  23S ribosomal RNA  83.96 
 
 		 2908 bp  391  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r23  23S ribosomal RNA  83.96 
 
 		 2908 bp  391  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r25  23S ribosomal RNA  83.96 
 
 		 2907 bp  391  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r29  23S ribosomal RNA  83.96 
 
 		 2907 bp  391  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0041  23S ribosomal RNA  83.93 
 
 		 3027 bp  389  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0513089  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0025  23S ribosomal RNA  83.93 
 
 		 3027 bp  389  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337062  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0028  23S ribosomal RNA  87.7 
 
 		 2925 bp  385  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0156904  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0004  23S ribosomal RNA  87.7 
 
 		 2925 bp  385  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180219  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0050  23S ribosomal RNA  84.16 
 
 		 2946 bp  387  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.074771  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0055  23S ribosomal RNA  87.7 
 
 		 2925 bp  385  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.125103  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0023  23S ribosomal RNA  87.7 
 
 		 2925 bp  385  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0220545  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0059  23S ribosomal RNA  84.16 
 
 		 2943 bp  387  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.12329  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r17  23S ribosomal RNA  85.91 
 
 		 2908 bp  387  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0039  23S ribosomal RNA  83.85 
 
 		 3105 bp  379  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0522575  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0047  23S ribosomal RNA  83.85 
 
 		 3105 bp  379  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.137502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0035  23S ribosomal RNA  83.63 
 
 		 3116 bp  377  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.192227 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0055  23S ribosomal RNA  83.63 
 
 		 3129 bp  377  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639179  decreased coverage  0.00060371 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0027  23S ribosomal RNA  83.63 
 
 		 3129 bp  377  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.344785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0017  23S ribosomal RNA  83.63 
 
 		 3129 bp  377  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.78829 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0004  23S ribosomal RNA  83.63 
 
 		 3129 bp  377  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5742  23S ribosomal RNA  83.76 
 
 		 2908 bp  373  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5751  23S ribosomal RNA  83.76 
 
 		 2909 bp  373  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5754  23S ribosomal RNA  83.76 
 
 		 2909 bp  373  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5769  23S ribosomal RNA  83.76 
 
 		 2908 bp  373  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00191145  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-2  23S ribosomal RNA  83.76 
 
 		 2911 bp  373  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-3  23S ribosomal RNA  83.76 
 
 		 2851 bp  373  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-4  23S ribosomal RNA  83.76 
 
 		 2911 bp  373  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-5  23S ribosomal RNA  83.76 
 
 		 2911 bp  373  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-6  23S ribosomal RNA  83.76 
 
 		 2911 bp  373  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-8  23S ribosomal RNA  83.76 
 
 		 2911 bp  373  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_1  23S ribosomal RNA  83.76 
 
 		 2912 bp  373  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_13  23S ribosomal RNA  83.76 
 
 		 2911 bp  373  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_2  23S ribosomal RNA  83.76 
 
 		 2911 bp  373  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_3  23S ribosomal RNA  83.76 
 
 		 2911 bp  373  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_4  23S ribosomal RNA  83.76 
 
 		 2911 bp  373  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0824907  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_5  23S ribosomal RNA  83.76 
 
 		 2911 bp  373  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_6  23S ribosomal RNA  83.76 
 
 		 2911 bp  373  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_8  23S ribosomal RNA  83.76 
 
 		 2911 bp  373  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_9  23S ribosomal RNA  83.76 
 
 		 2912 bp  373  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SA  23S ribosomal RNA  83.76 
 
 		 2908 bp  373  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.479202  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SB  23S ribosomal RNA  83.76 
 
 		 2908 bp  373  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SC  23S ribosomal RNA  83.76 
 
 		 2908 bp  373  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SD  23S ribosomal RNA  83.76 
 
 		 2908 bp  373  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000431114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>