More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0456 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0456  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  100 
 
 
444 aa  867    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7662  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  48.2 
 
 
412 aa  288  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0916  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50 
 
 
396 aa  281  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.5424  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2935  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstA  45.34 
 
 
297 aa  192  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8333  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  39.07 
 
 
291 aa  180  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0354  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.79 
 
 
354 aa  166  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0932568  normal  0.0141277 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4263  phosphate ABC transporter permease  42.47 
 
 
354 aa  164  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0591  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45 
 
 
299 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8262  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.39 
 
 
694 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735974  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37640  phosphate ABC transporter membrane protein  37.97 
 
 
364 aa  158  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.124306 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4380  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.71 
 
 
359 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2742  phosphate ABC transporter permease  40.42 
 
 
361 aa  155  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00664487  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06960  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  38.49 
 
 
383 aa  154  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0093  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.85 
 
 
298 aa  154  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4650  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.26 
 
 
362 aa  155  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4261  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.67 
 
 
358 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31850  phosphate ABC transporter membrane protein  43.57 
 
 
365 aa  152  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6819  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.57 
 
 
304 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3541  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.47 
 
 
304 aa  150  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0660  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.35 
 
 
354 aa  149  8e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000330308 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2215  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstA  37.7 
 
 
306 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.59321  normal  0.136565 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3424  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.55 
 
 
309 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1291  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.74 
 
 
284 aa  146  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0364  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.36 
 
 
370 aa  145  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3924  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.12 
 
 
317 aa  145  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4900  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.94 
 
 
300 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79916  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1663  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.87 
 
 
300 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.481341  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4517  phosphate ABC transporter permease  35.94 
 
 
300 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4604  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.94 
 
 
300 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467059  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5090  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.72 
 
 
300 aa  144  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142964  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4979  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.56 
 
 
359 aa  143  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1070  phosphate ABC transporter permease  36.33 
 
 
332 aa  142  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2962  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.04 
 
 
322 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2741  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.87 
 
 
281 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2080  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.68 
 
 
357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0820  phosphate ABC transporter permease  40.93 
 
 
291 aa  139  8.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0199  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.8 
 
 
277 aa  138  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.998664  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1600  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.67 
 
 
288 aa  138  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10948  phosphate-transport system integral membrane ABC transporter pstA1  38.82 
 
 
304 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0873  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.32 
 
 
303 aa  135  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.501959  normal  0.143992 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1138  phosphate transport system permease protein 2  34.88 
 
 
281 aa  134  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.743483  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01630  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  37.76 
 
 
367 aa  132  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1274  phosphate transporter permease subunit PtsA  34.88 
 
 
294 aa  130  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.40238 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2812  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.21 
 
 
288 aa  130  7.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1155  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.53 
 
 
284 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0383637  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2560  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  33.33 
 
 
280 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001094  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1516  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  33.33 
 
 
280 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.313214  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1438  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  36.53 
 
 
284 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2966  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.75 
 
 
317 aa  129  8.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0884  phosphate transporter permease subunit PtsA  34.88 
 
 
298 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0561416 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2254  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.81 
 
 
286 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236094  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2221  phosphate ABC transporter permease  37.84 
 
 
304 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.155385 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1827  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  33.62 
 
 
270 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2313  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.15 
 
 
294 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733291  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4916  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.41 
 
 
294 aa  128  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345514  normal  0.348017 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1886  phosphate ABC transporter permease  31.37 
 
 
281 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0204  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.51 
 
 
369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2856  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.35 
 
 
298 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1928  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit PstA  37.39 
 
 
304 aa  127  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0575886  normal  0.0327322 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2973  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit  35.75 
 
 
293 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0223  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  33.74 
 
 
345 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2628  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.07 
 
 
294 aa  127  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.381415  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1488  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.74 
 
 
293 aa  127  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2771  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.28 
 
 
297 aa  126  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.47464  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5387  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.51 
 
 
303 aa  126  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2370  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.74 
 
 
293 aa  127  6e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.643879 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2268  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.04 
 
 
299 aa  126  8.000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2685  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.31 
 
 
301 aa  126  9e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.206864  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3271  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.31 
 
 
301 aa  126  9e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176924  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2504  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  32.84 
 
 
280 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2982  phosphate ABC transporter permease  34.98 
 
 
649 aa  125  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1268  phosphate transporter permease subunit PtsA  34.88 
 
 
298 aa  126  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.373526  normal  0.214152 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2204  phosphate transporter permease subunit PtsA  34.42 
 
 
290 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0576  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.35 
 
 
297 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433378  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1620  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.35 
 
 
297 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1517  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.35 
 
 
297 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1487  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.35 
 
 
297 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1293  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.35 
 
 
297 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0575  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.35 
 
 
297 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2277  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.35 
 
 
646 aa  124  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0481  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.68 
 
 
645 aa  124  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1918  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.27 
 
 
604 aa  124  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.396887  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2018  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.28 
 
 
297 aa  124  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1509  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  31.58 
 
 
276 aa  124  5e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0581  phosphate transporter permease subunit PtsA  34.25 
 
 
294 aa  123  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1163  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34 
 
 
280 aa  123  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2165  phosphate transporter permease subunit PtsA  34.88 
 
 
300 aa  123  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0795993  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25600  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  36 
 
 
388 aa  123  8e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0714898  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0743  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  32.67 
 
 
277 aa  122  9e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000430828  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1953  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  32.18 
 
 
294 aa  122  9e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.22501  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4150  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.56 
 
 
340 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.28828  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0014  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.62 
 
 
293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252026  normal  0.138563 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4445  phosphate transporter permease subunit PtsA  34.42 
 
 
297 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1273  phosphate transporter permease subunit PtsA  34.88 
 
 
297 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0821  phosphate transporter permease subunit PtsA  34.88 
 
 
297 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1302  phosphate transporter permease subunit PtsA  34.88 
 
 
297 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.512627  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1993  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.22 
 
 
295 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1179  phosphate transporter permease subunit PtsA  34.88 
 
 
297 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1927  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.57 
 
 
294 aa  120  6e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0747671  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1191  phosphate transporter permease subunit PtsA  34.88 
 
 
297 aa  120  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.403091  normal  0.235503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>